RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	CNR1	P21554	472 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	PIGA	P37287	484 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	HNMT	P50135	292 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ART1	P52961	327 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	MTTP	P55157	894 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ARL4C	P56559	192 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	CDKL1	Q00532	357 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	DR1	Q01658	176 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	TFF3	Q07654	80 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	DOC2A	Q14183	400 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	MORF4L2	Q15014	288 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	TGFBI	Q15582	683 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	PAOX	Q6QHF9	649 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	RNF175	Q8N4F7	328 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	SERINC2	Q96SA4	455 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	SMC6	Q96SB8	1091 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	EXO5	Q9H790	373 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	AKAP9	Q99996	3911 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ACOT7	O00154	380 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	CLEC3A	O75596	197 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	LRAT	O95237	230 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	TGFB1	P01137	390 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	CCDC166	P0CW27	439 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	CCL3	P10147	92 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	IGFBP2	P18065	325 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	CD22	P20273	847 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	MSX1	P28360	303 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	SLC12A2	P55011	1212 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	RNF4	P78317	190 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	TERF2	Q15554	542 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	OR4D1	Q15615	310 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	RTL6	Q6ICC9	239 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	GPSM1	Q86YR5	675 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	TTL	Q8NG68	377 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	VPS39	Q96JC1	886 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	LDAH	Q9H6V9	325 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	CD274	Q9NZQ7	290 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	SNX24	Q9Y343	169 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078		A0A088AWK7	358 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078		A0A0G2JNJ9	132 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	HRK	O00198	91 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	GLI4	P10075	376 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	PCNA	P12004	261 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ACVR2A	P27037	513 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	SSTR1	P30872	391 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	MSH2	P43246	934 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	KCNC1	P48547	511 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	DLX5	P56178	289 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ASPH	Q12797	758 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	RTL4	Q6ZR62	310 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	MORN4	Q8NDC4	146 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ANKRD7	Q92527	254 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	SLCO2A1	Q92959	643 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	LIME1	Q9H400	295 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	NT5DC2	Q9H857	520 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078		Q9UFV3	132 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	TP73	O15350	636 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	STK16	O75716	305 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078	ZWINT	O95229	277 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-262	ENST00000628078		P04436	131 aa		12.48	□□□□□ -0.41

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