RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 PHF11Q9UIL8 331 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 DAPP1Q9UN19 280 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa23.56■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PRB8 838 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 NELFEP18615 380 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 GRK6P43250 576 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL4DP49703 201 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 LIM2P55344 173 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 LIPEQ05469 1076 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNAB1Q14722 419 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXW10Q5XX13 1052 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf67Q8IYJ2 551 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 SUMF1Q8NBK3 374 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ALG2Q9H553 416 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 LYRM4Q9HD34 91 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 CES1P1Q9UKY3 287 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 SCN3AQ9NY46 2000 aa23.55■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 FITM1A5D6W6 292 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 A8MU76 341 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ACOT8O14734 319 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 PDPK1O15530 556 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJB6O75190 326 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 C6orf47O95873 294 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF806P0C7X5 589 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 GSK3BP49841 420 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 HBA1P69905 142 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF621Q6ZSS3 439 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4D9Q8NGE8 314 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4A15Q8NGL6 344 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf90Q96M02 699 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 DPYSL5Q9BPU6 564 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 UNC13CQ8NB66 2214 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO15AQ9UKN7 3530 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BMH7 237 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 PGRMC2O15173 223 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJA2O60884 412 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 MED26O95402 600 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 MSL3P1P0C860 447 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFRSF17Q02223 184 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFA9Q16795 377 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 INAVAQ3KP66 663 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 GARNL3Q5VVW2 1013 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM180BQ6P0A1 224 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC48A1Q6P1K1 146 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHAC1Q9H158 963 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKHQ9HCJ1 492 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 SLAMF7Q9NQ25 335 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 MS4A12Q9NXJ0 267 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R9Q9NYW1 312 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 UTS2RQ9UKP6 389 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 VPS4AQ9UN37 437 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGB4Q9UN71 923 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 AP3M1Q9Y2T2 418 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 GMEB1Q9Y692 573 aa23.54■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 HYKKA2RU49 373 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF860A6NHJ4 632 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 GLOD5A6NK44 160 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 WASHC1A8K0Z3 465 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 FLRT2O43155 660 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD34CP0C6C1 535 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 NR2F6P10588 404 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 CPN2P22792 545 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 EMP3P54852 163 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 CCNIQ14094 377 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM53BQ14153 422 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 TMTC4Q5T4D3 741 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 FRYLO94915 3013 aa23.53■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTS20P59510 1910 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 NVLO15381 856 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 OLR1P78380 273 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 BNIP2Q12982 314 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 FLOT2Q14254 428 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 MLC1Q15049 377 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR19Q15760 415 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 OR9A4Q8NGU2 314 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5P2Q8WZ92 322 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF583Q96ND8 569 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ECSITQ9BQ95 431 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM4Q9C037 500 aa23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms