RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627393.1

PCNP-208, Transcript of PEST proteolytic signal containing nuclear protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PCNP, Length 136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNP-208ENST00000627393 TRIM2Q9C040 744 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 FANCFQ9NPI8 374 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 NECTIN3Q9NQS3 549 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 PRDM9Q9NQV7 894 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 CBLN4Q9NTU7 201 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 RMND1Q9NWS8 449 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 MOCS1Q9NZB8 636 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 CNIH4Q9P003 139 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 IMPACTQ9P2X3 320 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 CLCF1Q9UBD9 225 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 DTX4Q9Y2E6 619 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 SNX8Q9Y5X2 465 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 FKBP7Q9Y680 259 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 ARL5AQ9Y689 179 aa3□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 LCE6AA0A183 80 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 A0A1W2PPV9 198 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 SYCE3A1L190 88 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 SLC22A31A6NKX4 558 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 H7C417 338 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 PLOD2O00469 737 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 HAT1O14929 419 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 EMC8O43402 210 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 CHST10O43529 356 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 KIF5CO60282 957 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 RAMP1O60894 148 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 GPC4O75487 556 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 AP2A2O94973 939 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 PPP1R3DO95685 299 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 TSPAN15O95858 294 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 TGM6O95932 706 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 CGAP01215 116 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 CD8BP10966 210 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 ATP1A3P13637 1013 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 SYT1P21579 422 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 OMGP23515 440 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 PRTN3P24158 256 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 ACRV1P26436 265 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 IL2RGP31785 369 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 FOXN2P32314 431 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 TTKP33981 857 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 FABP6P51161 128 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 JAM2P57087 298 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 SKP1P63208 163 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 PHC1P78364 1004 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 OLR1P78380 273 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 IRF9Q00978 393 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 FMO1Q01740 532 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 CDR2Q01850 454 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 CHRNB3Q05901 458 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 TYRO3Q06418 890 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 BSPH1Q075Z2 132 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 HSPA14Q0VDF9 509 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 MAMLD1Q13495 774 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 CCNIQ14094 377 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 GRB7Q14451 532 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 FGFBP1Q14512 234 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 KRT81Q14533 505 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 TERF2Q15554 542 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 DPYSL2Q16555 572 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 GPR33Q49SQ1 333 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 EIPR1Q53HC9 387 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 COBLL1Q53SF7 1204 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 C11orf71Q6IPW1 123 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 KLHL10Q6JEL2 608 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 LEG1Q6P5S2 330 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 ADGRD1Q6QNK2 874 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 SBSNQ6UWP8 590 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 STAC2Q6ZMT1 411 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 RHOUQ7L0Q8 258 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 SNX20Q7Z614 316 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 SERPINA9Q86WD7 417 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 PDSS2Q86YH6 399 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 PIANPQ8IYJ0 282 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 ZNF619Q8N2I2 560 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 MUC15Q8N387 334 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 CNTD1Q8N815 330 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 CAMKVQ8NCB2 501 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 OR4K2Q8NGD2 314 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 GSDMBQ8TAX9 411 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 PAQR8Q8TEZ7 354 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 WFDC12Q8WWY7 111 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 SGCDQ92629 289 aa2.99□□□□□ -1.93
PCNP-208ENST00000627393 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms