RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 SAC3D1A6NKF1 404 aa20.5■□□□□ 0.87
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SGMS1-210ENST00000619438 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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SGMS1-210ENST00000619438 SLC16A8O95907 504 aa20.5■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 RAP2AP10114 183 aa20.5■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 CCL4P13236 92 aa20.5■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 PAX7P23759 505 aa20.5■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 TACR1P25103 407 aa20.5■□□□□ 0.87
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SGMS1-210ENST00000619438 LCN9Q8WX39 176 aa20.47■□□□□ 0.87
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SGMS1-210ENST00000619438 OLAHQ9NV23 265 aa20.47■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 ASF1AQ9Y294 204 aa20.47■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa20.46■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 OR6C74A6NCV1 312 aa20.46■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 C9P02748 559 aa20.46■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 MYF6P23409 242 aa20.46■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 ABHD18Q0P651 414 aa20.46■□□□□ 0.87
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