RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 HK2P52789 917 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 DR1Q01658 176 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 SLC22A16Q86VW1 577 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL7Q8IXQ5 586 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 OR14A16Q8NHC5 309 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
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PTPRF-216ENST00000617451 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa23.11■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 CNR1P21554 472 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 STX4Q12846 297 aa23.1■■□□□ 1.29
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PTPRF-216ENST00000617451 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 RTL4Q6ZR62 310 aa23.1■■□□□ 1.29
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PTPRF-216ENST00000617451 OR5M3Q8NGP4 307 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 OR8K3Q8NH51 312 aa23.1■■□□□ 1.29
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PTPRF-216ENST00000617451 SCYL1Q96KG9 808 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 F2RL3Q96RI0 385 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 OR8D2Q9GZM6 311 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
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PTPRF-216ENST00000617451 E7ESA3 106 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 G3V3Y1 287 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 CLGNO14967 610 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 IGHG3P01860 377 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
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PTPRF-216ENST00000617451 RNF4P78317 190 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 POU4F1Q01851 419 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 TGM3Q08188 693 aa23.09■■□□□ 1.29
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PTPRF-216ENST00000617451 FBXO48Q5FWF7 155 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 CDKL4Q5MAI5 379 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 GPSM1Q86YR5 675 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 SPATA6LQ8N4H0 392 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 GOLM1Q8NBJ4 401 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 OR5M9Q8NGP3 310 aa23.09■■□□□ 1.29
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PTPRF-216ENST00000617451 RUNDC3BQ96NL0 473 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 KCNC2Q96PR1 638 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 FAM173AQ9BQD7 235 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 LYRM4Q9HD34 91 aa23.09■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 BCKDKO14874 412 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 ZSCAN12O43309 604 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
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PTPRF-216ENST00000617451 EFCAB11Q9BUY7 163 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 IL1RL2Q9HB29 575 aa23.08■■□□□ 1.29
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PTPRF-216ENST00000617451 KCNN3Q9UGI6 736 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRF-216ENST00000617451 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
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PTPRF-216ENST00000617451 ITPR3Q14573 2671 aa23.08■■□□□ 1.29
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PTPRF-216ENST00000617451 C17orf105B2RV13 164 aa23.07■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 PIAS1O75925 651 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 TNNI3P19429 210 aa23.07■■□□□ 1.28
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PTPRF-216ENST00000617451 ROGDIQ9GZN7 287 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 CAB39LQ9H9S4 337 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 EML6Q6ZMW3 1958 aa23.07■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 FIGNL2A6NMB9 653 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC166P0CW27 439 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 EPORP19235 508 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEA5P43359 124 aa23.06■■□□□ 1.28
PTPRF-216ENST00000617451 LAPTM5Q13571 262 aa23.06■■□□□ 1.28
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