RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CNTF	P26441	200 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PIK3CB	P42338	1070 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CA7	P43166	264 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SETDB1	Q15047	1291 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRADD	Q15628	312 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	LIPJ	Q5W064	366 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PAOX	Q6QHF9	649 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	LAS2	Q8IYD9	372 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR7G3	Q8NG95	312 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	DGAT2	Q96PD7	388 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	MS4A8	Q9BY19	250 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	HES7	Q9BYE0	225 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	HPF1	Q9NWY4	346 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		10.23	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ASPDH	A6ND91	283 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	C17orf105	B2RV13	164 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRSS44	E7EML9	344 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ACOT7	O00154	380 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYR61	O00622	381 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ASNA1	O43681	348 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	NEURL1	O76050	574 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CD22	P20273	847 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	IRF9	Q00978	393 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLIN5	Q00G26	463 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLGLB1	Q02325	96 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	DLG1	Q12959	904 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLAMF1	Q13291	335 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	GTF2H2	Q13888	395 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	RELL1	Q8IUW5	271 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CNPY4	Q8N129	248 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	AMER2	Q8N7J2	671 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	KIF18A	Q8NI77	898 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	FRMD6	Q96NE9	622 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	NPAS2	Q99743	824 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	AICDA	Q9GZX7	198 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR51B5	Q9H339	312 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	IPPK	Q9H8X2	491 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	AHSP	Q9NZD4	102 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		10.22	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PEX1	O43933	1283 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR10H2	O60403	315 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRAMEF4	O60810	478 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	LDB3	O75112	727 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CLDN9	O95484	217 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	COL6A2	P12110	1019 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	COL8A1	P27658	744 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	DCT	P40126	519 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	MEOX1	P50221	254 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCNG1	P51959	295 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARFIP1	P53367	373 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCDH1	Q08174	1060 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ART3	Q13508	389 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF787	Q6DD87	383 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	XKRX	Q6PP77	449 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	OPN5	Q6U736	354 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		10.21	□□□□□ -0.77
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPR180	Q86V85	440 aa		10.21	□□□□□ -0.77

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