RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 RANP62826 216 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ATAT1Q5SQI0 421 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 COMMD7Q86VX2 200 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR6T1Q8NGN1 323 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF675Q8TD23 568 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM203Q969S6 136 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MAGIXQ9H6Y5 334 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 DNAJC5BQ9UF47 199 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SC5DO75845 299 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NFATC1O95644 943 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HEXBP07686 556 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CHRNB1P11230 501 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SCAPQ12770 1279 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PNCKQ6P2M8 343 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 IL26Q9NPH9 171 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FZD4Q9ULV1 537 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FZD10Q9ULW2 581 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FAM159BA6NKW6 160 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 E7EQ34 232 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FFAR2O15552 330 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TGFB1I1O43294 461 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CHRNA1P02708 482 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 APODP05090 189 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 DSTNP60981 165 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TPST2O60704 377 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ENGP17813 658 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MAN2A2P49641 1150 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SFT2D3Q587I9 215 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PPTC7Q8NI37 304 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TTYH2Q9BSA4 534 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 GNG8Q9UK08 70 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TNS2Q63HR2 1409 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 SMLR1H3BR10 107 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CREG1O75629 220 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 AKR1A1P14550 325 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CREB1P16220 341 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 Q9N2J8 555 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KLHL21Q9UJP4 597 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CLEC3AO75596 197 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 IL33O95760 270 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR8U9P0C7N5 309 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MC1RQ01726 317 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KCNJ11Q14654 390 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CARM1Q86X55 608 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 TSSK2Q96PF2 358 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 WDR18Q9BV38 432 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CWH43Q9H720 699 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RNF215Q9Y6U7 377 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 F6UZH7 168 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PCDH7O60245 1069 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PRKACAP17612 351 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 RAB7AP51149 207 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 MEF2DQ14814 521 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRT-209ENST00000612229 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms