RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 GSTM5P46439 218 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 RAD23AP54725 363 aa24.25■■□□□ 1.47
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CAPNS1-204ENST00000587718 ILKQ13418 452 aa24.25■■□□□ 1.47
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CAPNS1-204ENST00000587718 FAM129CQ86XR2 697 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 DENND6BQ8NEG7 585 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2T29Q8NH02 315 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5K2Q8NHB8 316 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 SH3KBP1Q96B97 665 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 TOR3AQ9H497 397 aa24.21■■□□□ 1.47
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