RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 OR4K17Q8NGC6 315 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 EXTL2Q9UBQ6 330 aa20.54■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 GRID2O43424 1007 aa20.54■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM189A2Q15884 450 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.54■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 NAXEQ8NCW5 288 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 SLC2A13Q96QE2 648 aa20.54■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 PIP5K1AQ99755 562 aa20.54■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.54■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 GID4Q8IVV7 300 aa20.53■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC45A3Q96JT2 553 aa20.53■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 OAZ2O95190 189 aa20.53■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.53■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 VNN2O95498 520 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 GNSP15586 552 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 GRIA2P42262 883 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 SMURF1Q9HCE7 757 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 MKS1Q9NXB0 559 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 IFT172Q9UG01 1749 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 IRF5Q13568 498 aa20.53■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa20.53■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 SAMD12Q8N8I0 201 aa20.52■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 SH2B3Q9UQQ2 575 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 CASRP41180 1078 aa20.52■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 AIG1Q9NVV5 245 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRM-211ENST00000580170 VNN3Q9NY84 501 aa20.52■□□□□ 0.88
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PTPRM-211ENST00000580170 C12orf40Q86WS4 652 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 POGLUT1Q8NBL1 392 aa20.52■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 OR8K3Q8NH51 312 aa20.51■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 IFT52Q9Y366 437 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRM-211ENST00000580170 MEN1O00255 615 aa20.51■□□□□ 0.87
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PTPRM-211ENST00000580170 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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