RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568290.1

ATXN3-250, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-250ENST00000568290 TAB1Q15750 504 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 OCLNQ16625 522 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 ANKDD1AQ495B1 522 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 TMEM35AQ53FP2 167 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 FAM46CQ5VWP2 391 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 FRMPD2BQ6IN97 320 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 FAM71E1Q6IPT2 247 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 MZT2AQ6P582 158 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 CEP68Q76N32 757 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 RRM2BQ7LG56 351 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 COMMD6Q7Z4G1 85 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 VTCN1Q7Z7D3 282 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 TMEM150AQ86TG1 271 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 SLC22A16Q86VW1 577 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 NUDT13Q86X67 352 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 CMTM8Q8IZV2 173 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 NAGSQ8N159 534 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 SLC5A8Q8N695 610 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 KREMEN2Q8NCW0 462 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 PROKR2Q8NFJ6 384 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 OR2A12Q8NGT7 310 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 BBS10Q8TAM1 723 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 NDNFQ8TB73 568 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 CXorf40AQ8TE69 158 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 C16orf78Q8WTQ4 265 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 NEURL3Q96EH8 262 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 PDXPQ96GD0 296 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 MGLLQ99685 303 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 BTBD2Q9BX70 525 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 ANKRD19PQ9H560 264 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 TDP1Q9NUW8 608 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 KLHL28Q9NXS3 571 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 SAGE1Q9NXZ1 904 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 NDOR1Q9UHB4 597 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 IFT52Q9Y366 437 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 TTC3P53804 2025 aa7.3□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 TTC36A6NLP5 189 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 ZAR1LA6NP61 321 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 A8MX80 341 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 CENPBD1B2RD01 187 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 FAM25AB3EWG3 89 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 FAM25CB3EWG5 89 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 FAM25GB3EWG6 89 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 AXIN1O15169 862 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 TEX28O15482 410 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 ZW10O43264 779 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 AQP9O43315 295 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 TSPAN6O43657 245 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 FKTNO75072 461 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 LEFTY1O75610 366 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 SNAPC5O75971 98 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 C6orf47O95873 294 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 SLC16A8O95907 504 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 LGI1O95970 557 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 IL1AP01583 271 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 TFPTP0C1Z6 253 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 ADORA3P0DMS8 318 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 DBTP11182 482 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 TYRP14679 529 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 ALOX12P18054 663 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 ITGB7P26010 798 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 HLA-FP30511 346 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 TGFBR2P37173 567 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 MMP12P39900 470 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 SLC15A1P46059 708 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 RPS5P46782 204 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 KHKP50053 298 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 CCR8P51685 355 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 SMSP52788 366 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 MAPK12P53778 367 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 CRISP3P54108 245 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 EPHA5P54756 1037 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 NCS1P62166 190 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 LSM3P62310 102 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 TBPL1P62380 186 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 CYP4F8P98187 520 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 SEMG2Q02383 582 aa7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ATXN3-250ENST00000568290 IRF3Q14653 427 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms