RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	GCA	P28676	217 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	SSR2	P43308	183 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	GPR143	P51810	404 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	PHF21B	Q96EK2	531 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	VMP1	Q96GC9	406 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	NTMT1	Q9BV86	223 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	OR51B5	Q9H339	312 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	FETUB	Q9UGM5	382 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	PCTP	Q9UKL6	214 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	MAST4	O15021	2626 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	GTF3C1	Q12789	2109 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	WIPF3	A6NGB9	483 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	PLPP1	O14494	284 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	FCHO1	O14526	889 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	OR7A17	O14581	309 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	SH3BGRL	O75368	114 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	NEURL1	O76050	574 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	FAM153B	P0C7A2	387 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	GP1BB	P13224	206 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	CD46	P15529	392 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	PPP2R1B	P30154	601 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	CCNG1	P51959	295 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	RAP1GDS1	P52306	607 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	STX4	Q12846	297 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	CUL3	Q13618	768 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	SERTAD2	Q14140	314 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	FAM153C	Q494X1	144 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	SPINK14	Q6IE38	97 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	LCA5	Q86VQ0	697 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	RNF175	Q8N4F7	328 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	NCLN	Q969V3	563 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	C5orf34	Q96MH7	638 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	LRFN1	Q9P244	771 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	PHF11	Q9UIL8	331 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	ASPDH	A6ND91	283 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	LDLR	P01130	860 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	IFNA16	P05015	189 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	SBK3	P0C264	359 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	CPN2	P22792	545 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	CYB561	P49447	251 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	HLCS	P50747	726 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	TRAF3	Q13114	568 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	SLAMF1	Q13291	335 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	BIK	Q13323	160 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	SLC29A2	Q14542	456 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	C4orf17	Q53FE4	359 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	MORN4	Q8NDC4	146 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	CCDC77	Q9BR77	488 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
PKD1-231	ENST00000566784	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		12.91	□□□□□ -0.34

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