RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC28A2O43868 658 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 TRIM13O60858 407 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 OR4F21O95013 312 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 CHEK2O96017 543 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 GSTM5P46439 218 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 NAGLUP54802 743 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 TNFRSF17Q02223 184 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 RAPSNQ13702 412 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 IGFL2Q6UWQ7 119 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 LANCL3Q6ZV70 420 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM47BQ8NA70 645 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 CNDP1Q96KN2 507 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 RNF32Q9H0A6 362 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNK13Q9HB14 408 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 PCSK5Q92824 1860 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 BSNQ9UPA5 3926 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 CYR61O00622 381 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 CTIFO43310 598 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 MAOAP21397 527 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 NEK2P51955 445 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC26A5P58743 744 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF844Q08AG5 666 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SPIN4Q56A73 249 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 KIRREL3Q8IZU9 778 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 AGAP11Q8TF27 550 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 TSLPQ969D9 159 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 ART5Q96L15 291 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A0A6YYD5 115 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SERTM1A2A2V5 107 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 MANBAO00462 879 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 TM9SF1O15321 606 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SH3BGRLO75368 114 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 PDYNP01213 254 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 IFNA16P05015 189 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 NR2F6P10588 404 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 TSPAN8P19075 237 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 BSGP35613 385 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 CLCN2P51788 898 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 ARG2P78540 354 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 BTG2P78543 158 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 PLIN5Q00G26 463 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 TLR1Q15399 786 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 MEP1AQ16819 746 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 IMPG1Q17R60 797 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SGO1Q5FBB7 561 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 IQCKQ8N0W5 287 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 METTL4Q8N3J2 472 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 HORMAD2Q8N7B1 307 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 B3GNT7Q8NFL0 401 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 PGM2Q96G03 612 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 VMP1Q96GC9 406 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 CENPHQ9H3R5 247 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 PFDN4Q9NQP4 134 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 KCMF1Q9P0J7 381 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.8□□□□□ -0.04
RABGGTA-205ENST00000558534 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms