RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552210.1

ANKS1B-227, Transcript of ankyrin repeat and sterile alpha motif domain containing 1B, human

TSL 4

Gene ANKS1B, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANKS1B-227	ENST00000552210	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	TFEB	P19484	476 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	SAT1	P21673	171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	ARRB2	P32121	409 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	HNF1B	P35680	557 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CPA2	P48052	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	MVD	P53602	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	NAGLU	P54802	743 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	DCDC1	P59894	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	HERVK_113	P63132	956 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CYP4F2	P78329	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	IRX4	P78413	519 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	EPS8	Q12929	822 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	GPM6B	Q13491	265 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	PEX6	Q13608	980 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	KCNC3	Q14003	757 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	SEMA3A	Q14563	771 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	HERC3	Q15034	1050 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	PDGFRL	Q15198	375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	E2F5	Q15329	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	DUSP6	Q16828	381 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	FUT11	Q495W5	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	TTC23L	Q6PF05	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	TMEM25	Q86YD3	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	NDN	Q99608	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CCT7	Q99832	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	BBS2	Q9BXC9	721 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	COG4	Q9H9E3	785 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	SMOX	Q9NWM0	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CLEC4E	Q9ULY5	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CCL26	Q9Y258	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	OR51F1	A6NGY5	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210		A8MT66	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210		K7ERQ8	282 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	CCL22	O00626	93 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ANKS1B-227	ENST00000552210	GRID2	O43424	1007 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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