RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 ACOT4Q8N9L9 421 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 C16orf52Q8NHV5 167 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 UBE2E3Q969T4 207 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 PHF12Q96QT6 1004 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 CCDC77Q9BR77 488 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 OPTCQ9UBM4 332 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 ACOT9Q9Y305 439 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 ITPR2Q14571 2701 aa13.47□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 HMX2A2RU54 273 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 SUPT3HB4E1H0 165 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 LDB3O75112 727 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 SH3BGRLO75368 114 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 SUPT3HO75486 399 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 SCELO95171 688 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 IFNA16P05015 189 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 C2P06681 752 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 PCNAP12004 261 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 ABOP16442 354 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 SSR4P51571 173 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 IRF9Q00978 393 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 STX4Q12846 297 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 BMPR2Q13873 1038 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 CDSNQ15517 529 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 DEPDC1Q5TB30 811 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 GRHL2Q6ISB3 625 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 CHSY3Q70JA7 882 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 DOLPP1Q86YN1 238 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 RNF175Q8N4F7 328 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 ZNF321PQ8N8H1 164 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 MORN4Q8NDC4 146 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 OR7G3Q8NG95 312 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 RHEBL1Q8TAI7 183 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 KCTD4Q8WVF5 259 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 CMTM7Q96FZ5 175 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 MYOTQ9UBF9 498 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa13.46□□□□□ -0.25
CS-229ENST00000551936 NOTCH2Q04721 2471 aa13.46□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 A0A087X1B8 175 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 ESYT3A0FGR9 886 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 SAP18O00422 153 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 ADAM10O14672 748 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 HS6ST1O60243 411 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 OR2J2O76002 312 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 EPB42P16452 691 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 SERPINB1P30740 379 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 PTGER1P34995 402 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 RFC3P40938 356 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 SMSP52788 366 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 SERTAD2Q14140 314 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 ACAP2Q15057 778 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 AP5B1Q2VPB7 878 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 TMEM35AQ53FP2 167 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 MROH9Q5TGP6 573 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 OR4C11Q6IEV9 310 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 IL20RBQ6UXL0 311 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 HSDL2Q6YN16 418 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 MCEMP1Q8IX19 187 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 TEX9Q8N6V9 391 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 OR14A16Q8NHC5 309 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 AGAP11Q8TF27 550 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 LRRC1Q9BTT6 524 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 OR51B5Q9H339 312 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 CHST11Q9NPF2 352 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 DEPPQ9NTK1 212 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 ADGRE2Q9UHX3 823 aa13.45□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 CSMD1Q96PZ7 3565 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 EML6Q6ZMW3 1958 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 A0A1B0GTH9 108 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 SYCE1LA8MT33 242 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 A8MVJ9 347 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 C17orf105B2RV13 164 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 WWP2O00308 870 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 TFECO14948 347 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 KLK8O60259 260 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 OR6B1O95007 311 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 ETHE1O95571 254 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 TNNI3P19429 210 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 CPN2P22792 545 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 SSR2P43308 183 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 HK2P52789 917 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 GPR85P60893 370 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 SETDB1Q15047 1291 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 FAM83EQ2M2I3 478 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 CMPK2Q5EBM0 449 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 LIPJQ5W064 366 aa13.44□□□□□ -0.26
CS-229ENST00000551936 CCDC91Q7Z6B0 441 aa13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms