RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	TTL	Q8NG68	377 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2L5	Q8NG80	312 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKRD7	Q92527	254 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931		Q9UFV3	132 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	DAPP1	Q9UN19	280 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
LETMD1-231	ENST00000551931	MED12	Q93074	2177 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1B0GVC2	190 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	BCKDK	O14874	412 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	CTNS	O60931	367 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	CLEC3A	O75596	197 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ZWINT	O95229	277 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	CCL3	P10147	92 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	CNR1	P21554	472 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	HNMT	P50135	292 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	FOXO1	Q12778	655 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	RTL4	Q6ZR62	310 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	MORN4	Q8NDC4	146 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SERINC2	Q96SA4	455 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	LIME1	Q9H400	295 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		11.64	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A088AWK7	358 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	C17orf105	B2RV13	164 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	AQP7	O14520	342 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	TAPBP	O15533	448 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	LDB3	O75112	727 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP6AP2	O75787	350 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	CD99	P14209	185 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	CD22	P20273	847 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	GSTM2	P28161	218 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	MTTP	P55157	894 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF4	P78317	190 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ID2	Q02363	134 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	TGFBI	Q15582	683 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	PDIK1L	Q8N165	341 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT78	Q8N1N4	520 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ESAM	Q96AP7	390 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	F2RL3	Q96RI0	385 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	NT5DC2	Q9H857	520 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF358	Q9NW07	568 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		11.63	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	SUSD5	O60279	629 aa		11.62	□□□□□ -0.55
LETMD1-231	ENST00000551931	CTAG2	O75638	210 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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