RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 GAS6Q14393 721 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 DPYSL2Q16555 572 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 AMZ1Q400G9 498 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 SDHAF4Q5VUM1 108 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.08□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 SVOPLQ8N434 492 aa6.08□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 OR10H1Q9Y4A9 318 aa6.07□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PPM1JQ5JR12 505 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 LRRTM4Q86VH4 590 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PAQR7Q86WK9 346 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 LIX1Q8N485 282 aa6.07□□□□□ -1.44
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