RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 RAP1BP61224 184 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 RAP1AP62834 184 aa8.17□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 STOMP27105 288 aa8.16□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 GPR153Q6NV75 609 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 C5orf46Q6UWT4 87 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 SHFQ7M4L6 423 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 RNF130Q86XS8 419 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 OR52N2Q8NGI0 321 aa8.16□□□□□ -1.1
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