RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534323.1

BBOX1-208, Transcript of gamma-butyrobetaine hydroxylase 1, human

TSL 2

Gene BBOX1, Length 457 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBOX1-208	ENST00000534323	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	CENPU	Q71F23	418 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	MPP5	Q8N3R9	675 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	ZNF480	Q8WV37	535 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	SMPDL3A	Q92484	453 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	PEX13	Q92968	403 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	MFSD3	Q96ES6	412 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	MVB12A	Q96EY5	273 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	MAGED4	Q96JG8	741 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	PKP4	Q99569	1192 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	DESI2	Q9BSY9	194 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	AICDA	Q9GZX7	198 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	MMP25	Q9NPA2	562 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	SYBU	Q9NX95	663 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		3.33	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	STAB1	Q9NY15	2570 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	FEZF1	A0PJY2	475 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323		A8MUI8	341 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323		E9PLN8	166 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323		H0YIG0	161 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	GFY	I3L273	518 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	ASNA1	O43681	348 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	KDM1A	O60341	852 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	PHF2	O75151	1096 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	VPS26A	O75436	327 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	SLC25A12	O75746	678 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	TOX	O94900	526 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	IFNB1	P01574	187 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	TPM3	P06753	285 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	APRT	P07741	180 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	CYC1	P08574	325 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	ANXA5	P08758	320 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	COL6A2	P12110	1019 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	ZNF24	P17028	368 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	ADRA1D	P25100	572 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	MGAT1	P26572	445 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	CMPK1	P30085	196 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	PPP2R1B	P30154	601 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	FMO4	P31512	558 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	TTPA	P49638	278 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	PGGT1B	P53609	377 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	PNLIPRP1	P54315	467 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	SLC26A5	P58743	744 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	KRTAP10-11	P60412	298 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	OLR1	P78380	273 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	PRAME	P78395	509 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	RELA	Q04206	551 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	RBPJ	Q06330	500 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	CUL1	Q13616	776 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	FAM53B	Q14153	422 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	SFT2D3	Q587I9	215 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
BBOX1-208	ENST00000534323	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		3.32	□□□□□ -1.88

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