RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531432.1

PPP6R3-223, Transcript of protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, human

TSL 3

Gene PPP6R3, Length 589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP6R3-223	ENST00000531432	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	MADD	Q8WXG6	1647 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	PLCH2	O75038	1416 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	PIK3R4	Q99570	1358 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	TRIM64B	A6NI03	449 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432		A8MU76	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SCO2	O43819	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	KRT3	P12035	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	PKLR	P30613	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	EVC	P57679	992 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	MAPK11	Q15759	364 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ZNF597	Q96LX8	424 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ABCC1	P33527	1531 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	PFAS	O15067	1338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ZNF749	O43361	778 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	TNFSF12	O43508	249 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	MCM10	Q7L590	875 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SPATA18	Q8TC71	538 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	TBK1	Q9UHD2	729 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	GTF3C4	Q9UKN8	822 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	CDH7	Q9ULB5	785 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	RICTOR	Q6R327	1708 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ACOD1	A6NK06	481 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ANHX	E9PGG2	379 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	BBOX1	O75936	387 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	DES	P17661	470 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SLC1A3	P43003	542 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	IER3	P46695	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ATP4B	P51164	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	TIAM1	Q13009	1591 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SPINK14	Q6IE38	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SMPDL3A	Q92484	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PPP6R3-223	ENST00000531432	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms