RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NME2P1O60361 137 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC25A12O75746 678 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFAND5O76080 213 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACSL3O95573 720 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL6A2P12110 1019 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NME2P22392 152 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CNTFP26441 200 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ECHS1P30084 290 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAGEA12P43365 314 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PMP22Q01453 160 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STX4Q12846 297 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BIKQ13323 160 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAPKAPK3Q16644 382 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAOK1Q7L7X3 1001 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF227Q86WZ6 799 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MORN4Q8NDC4 146 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HUS1BQ8NHY5 278 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NCLNQ969V3 563 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM125Q96AQ2 219 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGMAQ96B86 450 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 REPS1Q96D71 796 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CENPKQ9BS16 269 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IPPKQ9H8X2 491 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACTR8Q9H981 624 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF180Q9UJW8 692 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBXW2Q9UKT8 454 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMCO1Q9UM00 188 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RTCAO00442 366 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRT38O76015 456 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IFNA16P05015 189 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP2R1BP30154 601 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SSR2P43308 183 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ST13P50502 369 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GTF2H2Q13888 395 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TECRLQ5HYJ1 363 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1QL3Q5VWW1 255 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLNKQ7Z7G1 428 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FJX1Q86VR8 437 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 L3MBTL4Q8NA19 623 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR14A16Q8NHC5 309 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR137Q96N19 417 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FRMD6Q96NE9 622 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAFAH2Q99487 392 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR51B5Q9H339 312 aa15.68■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITGA10O75578 1167 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CPN2P22792 545 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CA7P43166 264 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHEXP78562 749 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLAMF1Q13291 335 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CUL3Q13618 768 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTFR2Q6P444 385 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM156Q8N614 296 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP112Q8N8E3 955 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POGLUT1Q8NBL1 392 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR8K3Q8NH51 312 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF18AQ8NI77 898 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TANKQ92844 425 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DMRT3Q9NQL9 472 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPT2Q9UMR5 302 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF835Q9Y2P0 537 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYO7BQ6PIF6 2116 aa15.67■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LRRC14BA6NHZ5 514 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM200CA6NKL6 621 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAP18O00422 153 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 STX16O14662 325 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZG16O60844 167 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LDB3O75112 727 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SH3BGRLO75368 114 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WISP2O76076 250 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CLDN9O95484 217 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNNI3P19429 210 aa15.66■□□□□ 0.1
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms