RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 SH2D4BQ5SQS7 431 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 ATG16L1Q676U5 607 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 EFCAB3Q8N7B9 438 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM76AQ8TAV0 307 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 CHTF18Q8WVB6 975 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 TANKQ92844 425 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 EXTL1Q92935 676 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 HBEGFQ99075 208 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 TUBB6Q9BUF5 446 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF700Q9H0M5 742 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 SIRT5Q9NXA8 310 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 LOC400499M0QZD8 3231 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 MGAQ8IWI9 3026 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 NPIPB8E9PQR5 432 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 CTNSO60931 367 aa25.22■■□□□ 1.63
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SH3BP2-212ENST00000508338 PRPH2P23942 346 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC1A6P48664 564 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 MAPK12P53778 367 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 TNFRSF17Q02223 184 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC13A2Q13183 592 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 CLEC6AQ6EIG7 209 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM47BQ8NA70 645 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 MGARPQ8TDB4 240 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 MLXIPLQ9NP71 852 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 MCM8Q9UJA3 840 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 FBXW2Q9UKT8 454 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 RAP2CQ9Y3L5 183 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 ITPR1Q14643 2758 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM227AF5H4B4 570 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 MKRN2OSH3BPM6 223 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 PROM1O43490 865 aa25.21■■□□□ 1.63
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SH3BP2-212ENST00000508338 SPDYAQ5MJ70 313 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 FAAH2Q6GMR7 532 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 GALNT18Q6P9A2 607 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKRD37Q7Z713 158 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 SCUBE1Q8IWY4 988 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 ASB4Q9Y574 426 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 SCN2AQ99250 2005 aa25.2■■□□□ 1.63
SH3BP2-212ENST00000508338 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 TMPRSS11DO60235 418 aa25.2■■□□□ 1.62
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SH3BP2-212ENST00000508338 NR2F6P10588 404 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 COX6A1P12074 109 aa25.2■■□□□ 1.62
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SH3BP2-212ENST00000508338 POLE2P56282 527 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 HMGCS1Q01581 520 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 TWIST2Q8WVJ9 160 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 LPAR4Q99677 370 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 FAIM2Q9BWQ8 316 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 THAP1Q9NVV9 213 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 OR4D2P58180 307 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP2R2AP63151 447 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 BTG2P78543 158 aa25.19■■□□□ 1.62
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SH3BP2-212ENST00000508338 TERF2Q15554 542 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM151BQ8IW70 566 aa25.19■■□□□ 1.62
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SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF446Q9NWS9 450 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 HAO1Q9UJM8 370 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 FIS1Q9Y3D6 152 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 ATG4BQ9Y4P1 393 aa25.19■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 CACNA1GO43497 2377 aa25.18■■□□□ 1.62
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SH3BP2-212ENST00000508338 EXT1Q16394 746 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 LINC00303Q3SY05 128 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 UGT3A2Q3SY77 523 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 SFT2D3Q587I9 215 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 HSP90B2PQ58FF3 399 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 SCIMPQ6UWF3 145 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 DDIASQ8IXT1 998 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 KBTBD2Q8IY47 623 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP2-212ENST00000508338 TSLPQ969D9 159 aa25.18■■□□□ 1.62
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