RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 MFSD4BQ5TF39 518 aa2.79□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 CFAP161Q6P656 301 aa2.79□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 NHLRC1Q6VVB1 395 aa2.79□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 ADCK2Q7Z695 626 aa2.79□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 IQUBQ8NA54 791 aa2.79□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 C8orf46Q8TAG6 207 aa2.79□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 TBCKQ8TEA7 893 aa2.79□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 HEXDCQ8WVB3 486 aa2.79□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 MAGEB18Q96M61 343 aa2.79□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 P2RX6O15547 441 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 TSC22D2O75157 780 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 LYPD3O95274 346 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 SRD5A2P31213 254 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 ID1P41134 155 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 CRKLP46109 303 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 SLC25A1P53007 311 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 PRKCEQ02156 737 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 CEACAM7Q14002 265 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 C17orf58Q2M2W7 97 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 HYAL4Q2M3T9 481 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 NLRP14Q86W24 1093 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM99Q8N816 258 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 LINC01006Q8NI28 216 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 FAM129AQ9BZQ8 928 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 ANKRD2Q9GZV1 360 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 NT5DC2Q9H857 520 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 VIPAS39Q9H9C1 493 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 GMEB2Q9UKD1 530 aa2.78□□□□□ -1.96
UBE2B-202ENST00000499038 CCDC162PA2VCL2 907 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 CCDC188H7C350 402 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 UBE2CO00762 179 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 GRAP2O75791 330 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 APBB3O95704 486 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 CCDC175P0C221 793 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 HSD17B1P14061 328 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 LBPP18428 481 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 ACKR3P25106 362 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 PSMB4P28070 264 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 PPP2R1BP30154 601 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 PRKAR2BP31323 418 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 TNFRSF4P43489 277 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 PPP5CP53041 499 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 UCNP55089 124 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF273Q14593 569 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 KIAA0040Q15053 153 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 TCP11X2Q5H9J9 407 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 PP632Q6XCG6 107 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF730Q6ZMV8 503 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 UBQLNLQ8IYU4 475 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 SMYD1Q8NB12 490 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 GPR148Q8TDV2 347 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 VPS33AQ96AX1 596 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF799Q96GE5 643 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 CDHR1Q96JP9 859 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 POLR3GLQ9BT43 218 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 RABEP2Q9H5N1 569 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 AMBNQ9NP70 447 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 ABCC13Q9NSE7 274 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa2.77□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 TSPY2A6NKD2 308 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 ANXA2P2A6NMY6 339 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 SAP18O00422 153 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 ACSL4O60488 711 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 CD1EP15812 388 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 MAGEA9P43362 315 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 ISXQ2M1V0 245 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 AGAP6Q5VW22 663 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 TDHQ8IZJ6 230 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 RNF149Q8NC42 400 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 OR2L5Q8NG80 312 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 VN1R17PQ8TDU5 208 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 CCM2Q9BSQ5 444 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 C5AR2Q9P296 337 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 ABCG2Q9UNQ0 655 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 RNF24Q9Y225 148 aa2.76□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 A0A0B4J203 849 aa2.75□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 FAM86B1E9PN63 330 aa2.75□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 IGHG3P01860 377 aa2.75□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 PROS1P07225 676 aa2.75□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 FHP07954 510 aa2.75□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 FAM86B2P0C5J1 330 aa2.75□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 ANKRD34CP0C6C1 535 aa2.75□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 PGAM2P15259 253 aa2.75□□□□□ -1.97
UBE2B-202ENST00000499038 PDGFRAP16234 1089 aa2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms