RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487476.5

NF1-211, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NF1, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-211ENST00000487476 HCN3Q9P1Z3 774 aa15.96■□□□□ 0.15
NF1-211ENST00000487476 TAGLN3Q9UI15 199 aa15.96■□□□□ 0.15
NF1-211ENST00000487476 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NF1-211ENST00000487476 B3GALT2O43825 422 aa15.96■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 IL3P08700 152 aa15.96■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 PRPS2P11908 318 aa15.96■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 MAPK1P28482 360 aa15.96■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 ARFIP1P53367 373 aa15.96■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 EMP3P54852 163 aa15.96■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 ZNF763Q0D2J5 394 aa15.96■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 SLC9A5Q14940 896 aa15.96■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 GSTA3Q16772 222 aa15.96■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 KBTBD2Q8IY47 623 aa15.96■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 PROKR1Q8TCW9 393 aa15.96■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 CCDC106Q9BWC9 280 aa15.96■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 A0A1W2PR48 441 aa15.95■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 ENO4A6NNW6 628 aa15.95■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 FAM227AF5H4B4 570 aa15.95■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 NSA2O95478 260 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 ACPPP15309 386 aa15.95■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 TSFMP43897 325 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 LIM2P55344 173 aa15.95■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 C18orf63Q68DL7 685 aa15.95■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa15.95■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 RHBDD2Q6NTF9 364 aa15.95■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 MIER2Q8N344 545 aa15.95■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 CLPTM1LQ96KA5 538 aa15.95■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 CSF3RQ99062 836 aa15.95■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa15.95■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 GLOD5A6NK44 160 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 DSCR3O14972 297 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 CHST10O43529 356 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 ARSFP54793 590 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 SQLEQ14534 574 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 FUNDC1Q8IVP5 155 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 SCUBE1Q8IWY4 988 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 ULK2Q8IYT8 1036 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 CA13Q8N1Q1 262 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 CLIP3Q96DZ5 547 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 CCDC167Q9P0B6 97 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 C5AR2Q9P296 337 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 DAPP1Q9UN19 280 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 A0A1B0GX78 115 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 C2orf80Q0P641 193 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 PRSS53Q2L4Q9 553 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 AGKQ53H12 422 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 FAM71E1Q6IPT2 247 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 LCN10Q6JVE6 187 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 FAM180BQ6P0A1 224 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 GPR180Q86V85 440 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 EFCAB3Q8N7B9 438 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 RBCK1Q9BYM8 510 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 ROGDIQ9GZN7 287 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 SEC16AO15027 2179 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 FREM2Q5SZK8 3169 aa15.94■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 SPTBN2O15020 2390 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 A0A088AWK7 358 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 C9orf172C9J069 976 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 PGRMC2O15173 223 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 PROM1O43490 865 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 SLC22A3O75751 556 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 CIB2O75838 187 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 AVPR1BP47901 424 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 CLDN8P56748 225 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 STX1BP61266 288 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 KLF10Q13118 480 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 ERV3-1Q14264 604 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 DNAL1Q4LDG9 190 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 DCAF12Q5T6F0 453 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 RIMKLAQ8IXN7 391 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 FAM47BQ8NA70 645 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 TMEM52Q8NDY8 209 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 OR7A2PQ8NGA2 310 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 GBP5Q96PP8 586 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 TAAR9Q96RI9 348 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 ULBP3Q9BZM4 244 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 DPY30Q9C005 99 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 VCXQ9H320 206 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 MYNNQ9NPC7 610 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 SLC22A11Q9NSA0 550 aa15.93■□□□□ 0.14
NF1-211ENST00000487476 SRPK3Q9UPE1 567 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms