RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 IFNA16P05015 189 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 NUDT17P0C025 328 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 KRT4P19013 534 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CRHR1P34998 444 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 MEP1AQ16819 746 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CYP20A1Q6UW02 462 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR180Q86V85 440 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC5A8Q8N695 610 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CATSPER1Q8NEC5 780 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 SELENOMQ8WWX9 145 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 MIB2Q96AX9 1013 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM237Q96Q45 408 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 TRPS1Q9UHF7 1281 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 PHF11Q9UIL8 331 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 PPT2Q9UMR5 302 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 VPS4AQ9UN37 437 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 BSNQ9UPA5 3926 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CFAP46Q8IYW2 2715 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 PPP6CO00743 305 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 MYO1DO94832 1006 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 OR4F21O95013 312 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 TNNI3P19429 210 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 SERTAD2Q14140 314 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 FCRLBQ6BAA4 426 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 H3F3CQ6NXT2 135 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 LETMD1Q6P1Q0 360 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 SH2D5Q6ZV89 423 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CUZD1Q86UP6 607 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 C4orf33Q8N1A6 199 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CCNYL1Q8N7R7 359 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 OR1N1Q8NGS0 311 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 SUN3Q8TAQ9 357 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 L3HYPDHQ96EM0 354 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAP2Q9NPF8 381 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 NMRK1Q9NWW6 199 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 SEMA3DO95025 777 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 ETHE1O95571 254 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 WDPCPO95876 746 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 F10P00742 488 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 KRT6AP02538 564 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 PROCP04070 461 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 KRT6BP04259 564 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 TUBBP07437 444 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 HMOX2P30519 316 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 BSGP35613 385 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 KRT6CP48668 564 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 NAA20P61599 178 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 ACER2Q5QJU3 275 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 ZYG11AQ6WRX3 759 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 NUDT13Q86X67 352 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 ELP5Q8TE02 316 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF382Q96SR6 550 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 DEFB126Q9BYW3 111 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC29A3Q9BZD2 475 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF32Q9H0A6 362 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CDCP1Q9H5V8 836 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CLMPQ9H6B4 373 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 WDR41Q9HAD4 459 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 MID2Q9UJV3 735 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 EMCNQ9ULC0 261 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC12A4Q9UP95 1085 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAV17A0A0B4J275 112 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGAP10A1A4S6 786 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 PLIN3O60664 434 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 LDB3O75112 727 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 PDYNP01213 254 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM58BPP0C7Q3 252 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 PPP2R1BP30154 601 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CLCN2P51788 898 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 PKNOX1P55347 436 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC18A2Q05940 514 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 BIKQ13323 160 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 TERF2Q15554 542 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CFAP157Q5JU67 520 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 PAGE2Q7Z2X7 111 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CRLF3Q8IUI8 442 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 CDYL2Q8N8U2 506 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 B3GNT7Q8NFL0 401 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 RDH11Q8TC12 318 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-209ENST00000484097 METTL6Q8TCB7 284 aa18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms