RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	AICDA	Q9GZX7	198 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	IPPK	Q9H8X2	491 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	ACTR8	Q9H981	624 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF358	Q9NW07	568 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	9.45	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	AKAP9	Q99996	3911 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245		A8MT66	165 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	C4orf51	C9J302	202 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	CHST10	O43529	356 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	DIAPH2	O60879	1101 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	SEMA3D	O95025	777 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	OTC	P00480	354 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	SERPINA7	P05543	415 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	SERPIND1	P05546	499 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	PYGB	P11216	843 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	CCT5	P48643	541 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	EFNA3	P52797	238 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	HSD17B7	P56937	341 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	FOXL2	P58012	376 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	HERVK_113	P63132	956 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	PHEX	P78562	749 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	RHAG	Q02094	409 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	SLC18A2	Q05940	514 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	TRAF3	Q13114	568 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	BIK	Q13323	160 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	SYT16	Q17RD7	645 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	LGI4	Q8N135	537 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	SCYL1	Q96KG9	808 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	RNF32	Q9H0A6	362 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	KLHL31	Q9H511	634 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	LYRM4	Q9HD34	91 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	ABI3	Q9P2A4	366 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	MASP2	O00187	686 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	OR7A17	O14581	309 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	B3GALT2	O43825	422 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	RASAL1	O95294	804 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	STATH	P02808	62 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	SHBG	P04278	402 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	IMPDH1	P20839	514 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	TDGF1P3	P51864	188 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	PRKAA2	P54646	552 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	RAB38	P57729	211 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	RAB8A	P61006	207 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	TLE4	Q04727	773 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	PCOLCE	Q15113	449 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	TESK1	Q15569	626 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	EXT1	Q16394	746 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	CCDC153	Q494R4	210 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	FRG2	Q64ET8	278 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	CA13	Q8N1Q1	262 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	PSMF1	Q92530	271 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	PEX11G	Q96HA9	241 aa		9.43	□□□□□ -0.9
TTLL3-223	ENST00000466245	FRG2B	Q96QU4	278 aa		9.43	□□□□□ -0.9

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms