RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460289.5

PTPN4-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 4

Gene PTPN4, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-208ENST00000460289 CLNKQ7Z7G1 428 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 RNF175Q8N4F7 328 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 WDR20Q8TBZ3 569 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 ADAP2Q9NPF8 381 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 GABRR3A8MPY1 467 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 CRYABP02511 175 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 IFNA16P05015 189 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF766Q5HY98 468 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 TEX35Q5T0J7 233 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM151AQ8N4L1 468 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 APCDD1LQ8NCL9 501 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 OR52B6Q8NGF0 335 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 DNAJB8Q8NHS0 232 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 ACMSDQ8TDX5 336 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 VMP1Q96GC9 406 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 CDK15Q96Q40 435 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 VTI1BQ9UEU0 232 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 FBXW2Q9UKT8 454 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 PPT2Q9UMR5 302 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 TGFBR3LH3BV60 316 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 PLPP1O14494 284 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 FCHO1O14526 889 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 MAN1A2O60476 641 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 SBK3P0C264 359 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 CD46P15529 392 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 NEK2P51955 445 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 MLF1P58340 268 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 BIKQ13323 160 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 OR1C1Q15619 314 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 MILR1Q7Z6M3 343 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 GPR180Q86V85 440 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 ARMC10Q8N2F6 343 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 TAAR6Q96RI8 345 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 SERPINI1Q99574 410 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 SLX1AQ9BQ83 275 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 EPB41L4BQ9H329 900 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 ZBTB26Q9HCK0 441 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 ANKRD10Q9NXR5 420 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 PHF11Q9UIL8 331 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 LRRK2Q5S007 2527 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 A8MT66 165 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 OTCP00480 354 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 GSTA1P08263 222 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 RPS17P08708 135 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 TNFRSF8P28908 595 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 PPP2R1BP30154 601 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 GPR143P51810 404 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 GGTA1PQ4G0N0 100 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 FRG2Q64ET8 278 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 MORN4Q8NDC4 146 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 MDS2Q8NDY4 140 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 TANKQ92844 425 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 C5orf34Q96MH7 638 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 FRG2BQ96QU4 278 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 PPCSQ9HAB8 311 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM216Q9P0N5 145 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 LRFN1Q9P244 771 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPN4-208ENST00000460289 LDB3O75112 727 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 TNNI3P19429 210 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 CYB561P49447 251 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 IFT88Q13099 833 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 TRAF3Q13114 568 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 SPINK14Q6IE38 97 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 TMEM178AQ8NBL3 297 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 OR14A16Q8NHC5 309 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 NR4A3Q92570 626 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 NCLNQ969V3 563 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 TBK1Q9UHD2 729 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 DCDC2Q9UHG0 476 aa21.45■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 COL12A1Q99715 3063 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 SEMA7AO75326 666 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 ZFAND5O76080 213 aa21.44■■□□□ 1.02
PTPN4-208ENST00000460289 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms