RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 RASAL1O95294 804 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 SBK3P0C264 359 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 TDGF1P3P51864 188 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 MLF1P58340 268 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 RPS13P62277 151 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 OR4C11Q6IEV9 310 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 ARMC10Q8N2F6 343 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM151AQ8N4L1 468 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 OR52B6Q8NGF0 335 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 RGMAQ96B86 450 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 REPS1Q96D71 796 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 HES7Q9BYE0 225 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 DEFB126Q9BYW3 111 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 ADAP2Q9NPF8 381 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 PLPP1O14494 284 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 SMIM24O75264 130 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 GPR143P51810 404 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 RAP1GDS1P52306 607 aa22.1■■□□□ 1.13
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HOXB3-202ENST00000460160 TIFABQ6ZNK6 161 aa22.1■■□□□ 1.13
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HOXB3-202ENST00000460160 NCLNQ969V3 563 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 CDK15Q96Q40 435 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 ZBTB26Q9HCK0 441 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 NEURL1O76050 574 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 CLDN9O95484 217 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 CLCN2P51788 898 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 PMP22Q01453 160 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 MTBPQ96DY7 904 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 VMP1Q96GC9 406 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 SCMH1Q96GD3 660 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 KLHL1Q9NR64 748 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 FBXW2Q9UKT8 454 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 PCNX1Q96RV3 2341 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 CYSRT1A8MQ03 144 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 LDB3O75112 727 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 ETHE1O95571 254 aa22.08■■□□□ 1.13
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HOXB3-202ENST00000460160 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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HOXB3-202ENST00000460160 ATP6V1E2Q96A05 226 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 CENPKQ9BS16 269 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 NTMT1Q9BV86 223 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 LRFN1Q9P244 771 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 VTI1BQ9UEU0 232 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 SLC5A6Q9Y289 635 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 SPACA6W5XKT8 324 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXB3-202ENST00000460160 CDK2AP1O14519 115 aa22.07■■□□□ 1.12
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HOXB3-202ENST00000460160 CD46P15529 392 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 CPN2P22792 545 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 MST1P26927 711 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 ARFIP1P53367 373 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 ID2Q02363 134 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 STX4Q12846 297 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 SLAMF1Q13291 335 aa22.07■■□□□ 1.12
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HOXB3-202ENST00000460160 FETUBQ9UGM5 382 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 OSGIN2Q9Y236 505 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 A8MT66 165 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 DDAH2O95865 285 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 LDLRP01130 860 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 IFNA16P05015 189 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 GP1BBP13224 206 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB3-202ENST00000460160 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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