RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HES7Q9BYE0 225 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADAP2Q9NPF8 381 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCTPQ9UKL6 214 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPACA6W5XKT8 324 aa14.54□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLPP1O14494 284 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLDN9O95484 217 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLCN2P51788 898 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TDGF1P3P51864 188 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MLF1P58340 268 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PHEXP78562 749 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PMP22Q01453 160 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TIFABQ6ZNK6 161 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NCLNQ969V3 563 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATP6V1E2Q96A05 226 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RGMAQ96B86 450 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MTBPQ96DY7 904 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VMP1Q96GC9 406 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CENPKQ9BS16 269 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLHL1Q9NR64 748 aa14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LDB3O75112 727 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NEURL1O76050 574 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IFNA16P05015 189 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPS17P08708 135 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SBK3P0C264 359 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CD46P15529 392 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CPN2P22792 545 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR143P51810 404 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NEK2P51955 445 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCNG1P51959 295 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ID2Q02363 134 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STX4Q12846 297 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRAF3Q13114 568 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLAMF1Q13291 335 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC29A2Q14542 456 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SCMH1Q96GD3 660 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C5orf34Q96MH7 638 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRFN1Q9P244 771 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.52□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A8MT66 165 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FCHO1O14526 889 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ETHE1O95571 254 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MST1P26927 711 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SERTAD2Q14140 314 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HORMAD2Q8N7B1 307 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NTMT1Q9BV86 223 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FETUBQ9UGM5 382 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.51□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A1B0GTL3 188 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDK2AP1O14519 115 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FGF17O60258 216 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC25A12O75746 678 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DDAH2O95865 285 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SP1P08047 785 aa14.5□□□□□ -0.09
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GP1BBP13224 206 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms