RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448103.5

CASP12-208, Transcript of caspase 12 (gene/pseudogene), human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP12, Length 1,071 nt, Biotype polymorphic pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASP12-208	ENST00000448103	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	KLK2	P20151	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	ITGA3	P26006	1051 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	CLDN20	P56880	219 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	E2F5	Q15329	346 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	NAGS	Q8N159	534 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	TTC39C	Q8N584	583 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	ART4	Q93070	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	PIGT	Q969N2	578 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	EGLN2	Q96KS0	407 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	RASAL2	Q9UJF2	1139 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	GGA2	Q9UJY4	613 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	RAD51B	O15315	384 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	KCNN4	O15554	427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	GRID2	O43424	1007 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	NEMF	O60524	1076 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	PTP4A3	O75365	173 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	ZNF432	O94892	652 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	CSF2	P04141	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	AMD1	P17707	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	F8A1	P23610	371 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	MCM3	P25205	808 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	RPA1	P27694	616 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	HADHA	P40939	763 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	SGSH	P51688	502 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	PRAME	P78395	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	ZBED6	P86452	979 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	CNTN1	Q12860	1018 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	KYAT1	Q16773	422 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	PARG	Q86W56	976 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	KMT5C	Q86Y97	462 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	KIAA1143	Q96AT1	154 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	BMF	Q96LC9	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	ASB7	Q9H672	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	ACAN	P16112	2415 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CASP12-208	ENST00000448103	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASP12-208	ENST00000448103	FAM92A	A1XBS5	289 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASP12-208	ENST00000448103		A6NCN8	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASP12-208	ENST00000448103	ZSCAN5C	A6NGD5	496 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASP12-208	ENST00000448103	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASP12-208	ENST00000448103	PTGES3L	E9PB15	166 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASP12-208	ENST00000448103	PLPP2	O43688	288 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASP12-208	ENST00000448103	DOK2	O60496	412 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASP12-208	ENST00000448103	BEST1	O76090	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASP12-208	ENST00000448103	DEXI	O95424	95 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASP12-208	ENST00000448103	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASP12-208	ENST00000448103	TMEM11	P17152	192 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CASP12-208	ENST00000448103	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASP12-208	ENST00000448103	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASP12-208	ENST00000448103	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CASP12-208	ENST00000448103	AKT2	P31751	481 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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