RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	ID4	P47928	161 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	GLRB	P48167	497 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	GIPR	P48546	466 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	PNLIPRP1	P54315	467 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	IRF9	Q00978	393 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	KIR2DS3	Q14952	304 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	NR1D2	Q14995	579 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDUFA5	Q16718	116 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	PHF19	Q5T6S3	580 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	NKAIN2	Q5VXU1	208 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	OGFOD2	Q6N063	350 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	DHRS13	Q6UX07	377 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPRED1	Q7Z699	444 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC51B	Q86UW2	128 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	SMPDL3A	Q92484	453 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	STARD8	Q92502	1023 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPDL1	Q96EA4	605 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	MED8	Q96G25	268 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	MED30	Q96HR3	178 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	IL17F	Q96PD4	163 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	TGM7	Q96PF1	710 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD180	Q99467	661 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	IFT22	Q9H7X7	185 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	NTN4	Q9HB63	628 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	RDH14	Q9HBH5	336 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	WWOX	Q9NZC7	414 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC13A4	Q9UKG4	626 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNX6	Q9UNH7	406 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	ICK	Q9UPZ9	632 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	PDE10A	Q9Y233	779 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638		U3KQA8	63 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	CACNA1E	Q15878	2313 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	CACNA1H	O95180	2353 aa		5.91	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1W2PQM1	296 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	SNTN	A6NMZ2	147 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638		A8MU76	341 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	BTN3A3	O00478	584 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	RASSF9	O75901	435 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	FKBP9	O95302	570 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	MT-CO3	P00414	261 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	TPBGL	P0DKB5	382 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	CLU	P10909	449 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	JUP	P14923	745 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD1C	P29017	333 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	CMPK1	P30085	196 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	CAPZB	P47756	277 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	CDKL1	Q00532	357 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	LGALS3BP	Q08380	585 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	DLG1	Q12959	904 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	NAE1	Q13564	534 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	BLMH	Q13867	455 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	TGFBI	Q15582	683 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	AANAT	Q16613	207 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	CYP2A13	Q16696	494 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	PHKG1	Q16816	387 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		5.9	□□□□□ -1.46
ECHDC1-208	ENST00000436638	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46

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