RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427847.6

CREM-215, Transcript of cAMP responsive element modulator, human

TSL 3

Gene CREM, Length 635 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREM-215	ENST00000427847	GLRA2	P23416	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	DRD3	P35462	400 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	TIMP3	P35625	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	CPOX	P36551	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	GSTA3	Q16772	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	FRG2	Q64ET8	278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	FAM72B	Q86X60	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	NFKBID	Q8NI38	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	PERP	Q96FX8	193 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	FKRP	Q9H9S5	495 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	ABCA1	O95477	2261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	CALM1	P0DP23	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	CALM2	P0DP24	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	CALM3	P0DP25	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	MYOD1	P15172	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	CD1C	P29017	333 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	PTPN4	P29074	926 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	ALDH4A1	P30038	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	ARL2	P36404	184 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	PAFAH1B1	P43034	410 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	FMO5	P49326	533 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	ACTG1	P63261	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	PDE1B	Q01064	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	TAF10	Q12962	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	NFATC2	Q13469	925 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	TNK1	Q13470	666 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	FGFBP1	Q14512	234 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	CNDP1	Q96KN2	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	TBATA	Q96M53	351 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	TAAR6	Q96RI8	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847		A8MU76	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	TCF21	O43680	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	CDKN1A	P38936	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	MAPK9	P45984	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	PSMC5	P62195	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	PDIA5	Q14554	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	ALX1	Q15699	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	RDM1	Q8NG50	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	ST8SIA4	Q92187	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CREM-215	ENST00000427847	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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