RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 NR2C1P13056 603 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 OR3A3P47888 321 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 OR3A2P47893 321 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SLITRK4Q8IW52 837 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 CD200R1Q8TD46 325 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PPW3 197 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 FAAHO00519 579 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 XPNPEP2O43895 674 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 HPRP00739 348 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SWI5Q1ZZU3 235 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 MINDY2Q8NBR6 621 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF121Q9H920 327 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 OR1A2Q9Y585 309 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 VILLO15195 856 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 GATBO75879 557 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC16A8O95907 504 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2B6P58173 313 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF404Q494X3 552 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM35AQ53FP2 167 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 MTG2Q9H4K7 406 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 MCCC2Q9HCC0 563 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 GNG8Q9UK08 70 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 CHD4Q14839 1912 aa20.53■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 DRD2P14416 443 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 TUBA3EQ6PEY2 450 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC17A9Q9BYT1 436 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 GOLM1Q8NBJ4 401 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 STOML2Q9UJZ1 356 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 C7P10643 843 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ST3GAL4Q11206 333 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 ARFRP1Q13795 201 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB41Q5JT25 222 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 OR8H1Q8NGG4 311 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 CNIH3Q8TBE1 160 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 FANK1Q8TC84 345 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRJ-201ENST00000418331 J3QRK9 145 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 PEX12O00623 359 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 EPCAMP16422 314 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 C6orf141Q5SZD1 244 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC27A4Q6P1M0 643 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC36Q8IYA8 594 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2L3Q8NG85 312 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 FBXL8Q96CD0 374 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GVT2 93 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 PROM1O43490 865 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CLPXO76031 633 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 JUNDP17535 347 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB28P51157 221 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.873e-6■■■■■ 42.5
PTPRJ-201ENST00000418331 SUN3Q8TAQ9 357 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 USP3Q9Y6I4 520 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0U1RQS6 177 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC15A1P46059 708 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS26P62854 115 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM107Q6UX40 140 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 CSNK1A1LQ8N752 337 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 SETD6Q8TBK2 473 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 DMRTB1Q96MA1 342 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 G6PC3Q9BUM1 346 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ALS2Q96Q42 1657 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 NPC1O15118 1278 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 MT-ND5P03915 603 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 HSD17B1P14061 328 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 PDE7BQ9NP56 450 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ACSL6Q9UKU0 697 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 PENKP01210 267 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 HEXBP07686 556 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 F8A1P23610 371 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 PLGLB1Q02325 96 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 WSCD2Q2TBF2 565 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF542PQ5EBM4 170 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 OR4C11Q6IEV9 310 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 PGBD2Q6P3X8 592 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 TOMM5Q8N4H5 51 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 OR6N1Q8NGY5 312 aa20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PTPRJ-201ENST00000418331 GSTO2Q9H4Y5 243 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms