RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418244.5

FOXD3-AS1-201, FOXD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXD3-AS1, Length 941 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CUZD1Q86UP6 607 aa16.54■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ELP5Q8TE02 316 aa16.54■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRPC4APQ8TEL6 797 aa16.54■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HAS2Q92819 552 aa16.54■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MIB2Q96AX9 1013 aa16.54■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF382Q96SR6 550 aa16.54■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MS4A12Q9NXJ0 267 aa16.54■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TEKT2Q9UIF3 430 aa16.54■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRT4P19013 534 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TSPAN8P19075 237 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NAA20P61599 178 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SLC13A2Q13183 592 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SLAMF1Q13291 335 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IQCKQ8N0W5 287 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DNAJB14Q8TBM8 379 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RDH11Q8TC12 318 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CPT1CQ8TCG5 803 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TMEM109Q9BVC6 243 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ELOVL6Q9H5J4 265 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KCNK13Q9HB14 408 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MKS1Q9NXB0 559 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LUZP4Q9P127 313 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PHF11Q9UIL8 331 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 STK38LQ9Y2H1 464 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa16.53■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NBASA2RRP1 2371 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A0A0A6YYD5 115 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TLDC2A0PJX2 215 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 COPEO14579 308 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 OR4F21O95013 312 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MLYCDO95822 493 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TUBBP07437 444 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MYL2P10916 166 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CPN2P22792 545 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IFFO1Q0D2I5 559 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LCP2Q13094 533 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TLR1Q15399 786 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ABHD17BQ5VST6 288 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRABD2AQ86V40 505 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GPR180Q86V85 440 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NUDT13Q86X67 352 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LGI4Q8N135 537 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C4orf33Q8N1A6 199 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C7orf57Q8NEG2 295 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF354BQ96LW1 612 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GSTO2Q9H4Y5 243 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 BRF2Q9HAW0 419 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ADAP2Q9NPF8 381 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FBXW2Q9UKT8 454 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SNX6Q9UNH7 406 aa16.52■□□□□ 0.24
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DYTNA2CJ06 578 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A8MUI8 341 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EEDO75530 441 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 UQCRHP07919 91 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TNFSF10P50591 281 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PKNOX1P55347 436 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TAS2R50P59544 299 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DNAJB13P59910 316 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARG2P78540 354 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TNFRSF17Q02223 184 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SERTAD2Q14140 314 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IGFBP7Q16270 282 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ACER2Q5QJU3 275 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CLNKQ7Z7G1 428 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CRLF3Q8IUI8 442 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 B3GNT7Q8NFL0 401 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SELENOMQ8WWX9 145 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NPAS2Q99743 824 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 STMN3Q9NZ72 180 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 AHSPQ9NZD4 102 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 VTI1BQ9UEU0 232 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ADAM29Q9UKF5 820 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PLAAQ9Y263 795 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ATG4BQ9Y4P1 393 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ASB4Q9Y574 426 aa16.51■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A8MUA0 341 aa16.5■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CDK2AP1O14519 115 aa16.5■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PROM1O43490 865 aa16.5■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TMPRSS11DO60235 418 aa16.5■□□□□ 0.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MYO1DO94832 1006 aa16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms