RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 MED8Q96G25 268 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 THSD1Q9NS62 852 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 TRAPPC4Q9Y296 219 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 CCRL2O00421 344 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 IDH3BO43837 385 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 HSD3B1P14060 373 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 HSD3B2P26439 372 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 CRATP43155 626 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 NLRP8Q86W28 1048 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 FLCNQ8NFG4 579 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 OR4A15Q8NGL6 344 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 OR4K3Q96R72 315 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 C14orf119Q9NWQ9 140 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SNX8Q9Y5X2 465 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ALPK3Q96L96 1907 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ITGA2P17301 1181 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 PDHA2P29803 388 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 TIE1P35590 1138 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 HTR3AP46098 478 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 CDC42P60953 191 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 UBQLNLQ8IYU4 475 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 NXPE3Q969Y0 559 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 KCNS3Q9BQ31 491 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ROGDIQ9GZN7 287 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 RMI1Q9H9A7 625 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 BRF2Q9HAW0 419 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 GPATCH2Q9NW75 528 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ERVK13-1Q9NX77 482 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SLC6A14Q9UN76 642 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SH3D21A4FU49 640 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 PRAMEF25A6NGN4 478 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 H3BQ06 376 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SPINT1O43278 529 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ETHE1O95571 254 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SLC16A8O95907 504 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ADH1CP00326 375 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 MVDP53602 400 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 DTD2Q96FN9 168 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 COQ10AQ96MF6 247 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 PKP4Q99569 1192 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 TBC1D24Q9ULP9 559 aa23.43■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa23.43■■□□□ 1.34
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FAAP20-206ENST00000414253 H0YIV9 168 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ARHGAP33O14559 1287 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 NPC1O15118 1278 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 TNFRSF21O75509 655 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ADRA2AP08913 450 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ETFAP13804 333 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 IMPA1P29218 277 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 VIPR2P41587 438 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 LRRC74AQ0VAA2 488 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 COX20Q5RI15 118 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 GRHL2Q6ISB3 625 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 VN1R2Q8NFZ6 395 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SETD6Q8TBK2 473 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 HERVK_113Q902F9 699 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 TMCO6Q96DC7 493 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 C3orf14Q9HBI5 128 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SH3BP4Q9P0V3 963 aa23.42■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 FAM172BPA6NC97 362 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 MGAT4DA6NG13 374 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 PRRT4C9JH25 899 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SLITRK5O94991 958 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 CD72P21854 359 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
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FAAP20-206ENST00000414253 BCL7AQ4VC05 210 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ATAD3CQ5T2N8 411 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 TMC5Q6UXY8 1006 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 TAPBPLQ9BX59 468 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 GULP1Q9UBP9 304 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ENOPH1Q9UHY7 261 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SOD1P00441 154 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 PRNPP04156 253 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 TNFSF8P32971 234 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 HNF4AP41235 474 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 TP53BP2Q13625 1128 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SCARB2Q14108 478 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 STARD3Q14849 445 aa23.41■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SSX1Q16384 188 aa23.41■■□□□ 1.34
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