RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412145.5

PTPN3-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN3, Length 8,765 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-203ENST00000412145 IRF4Q15306 451 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 DUSP7Q16829 419 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 FAM214AQ32MH5 1076 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 NADK2Q4G0N4 442 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 C14orf28Q4W4Y0 310 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 NOXA1Q86UR1 476 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 OR5H2Q8NGV7 314 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 ZNF559Q9BR84 538 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 WDR18Q9BV38 432 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 MECRQ9BV79 373 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 NPAP1Q9NZP6 1156 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 SPEF2Q9C093 1822 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 KAT6AQ92794 2004 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 A0A096LPI6 279 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 KRBOX1C9JBD0 128 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 NPIPA2E9PIF3 369 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 NPIPA3F8WFD2 350 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 HMGCS1Q01581 520 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 GBX1Q14549 363 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 RAB35Q15286 201 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 ZNF781Q8N8C0 355 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 TMEM165Q9HC07 324 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 PRAMEF2O60811 474 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 MAP2K5Q13163 448 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 VGLL4Q14135 290 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 WDR45BQ5MNZ6 344 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 TICAM1Q8IUC6 712 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 TSSK2Q96PF2 358 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 SYT17Q9BSW7 474 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 TMED9Q9BVK6 235 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 SLC22A11Q9NSA0 550 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 UNC119BA6NIH7 251 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 A8MVM7 634 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 APOC3P02656 99 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 EPHX1P07099 455 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 FABP1P07148 127 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 SFTPBP07988 381 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 ICAM3P32942 547 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 SERPINF1P36955 418 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 CCL23P55773 120 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 TMEM35AQ53FP2 167 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 GPR139Q6DWJ6 353 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 OR10T2Q8NGX3 314 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 ZFAND1Q8TCF1 268 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 RXFP3Q9NSD7 469 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 QPCTLQ9NXS2 382 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 SSX5O60225 188 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 GABBR2O75899 941 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 GPR176Q14439 515 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 DACT2Q5SW24 774 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 NAPRTQ6XQN6 538 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 SPTSSAQ969W0 71 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 ZDHHC12Q96GR4 267 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 UHRF2Q96PU4 802 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 OPA3Q9H6K4 179 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 MST1RQ04912 1400 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 CDHR4A6H8M9 788 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 SHMT2P34897 504 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 PRPS1P60891 318 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 RAB4BP61018 213 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 DEFA6Q01524 100 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 FGL2Q14314 439 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 TLDC1Q6P9B6 456 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 SFXN5Q8TD22 340 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 C10orf82Q8WW14 230 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 CENPMQ9NSP4 180 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 ZNF226Q9NYT6 803 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 NENFQ9UMX5 172 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 SOCS5O75159 536 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 ALPIP09923 528 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPN3-203ENST00000412145 H2BFMP0C1H6 154 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms