RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410293.1

RNU6-447P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 447, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-447P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-447P-201ENST00000410293 C17orf107Q6ZR85 190 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 Q7L0L9 218 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CHST3Q7LGC8 479 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 NLRP14Q86W24 1093 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 TDHQ8IZJ6 230 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CEND1Q8N111 149 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SLC43A2Q8N370 569 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ZNF525Q8N782 197 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CLEC1AQ8NC01 280 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 Q8NFD4 153 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 BEST4Q8NFU0 473 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 LINC01006Q8NI28 216 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 PNPLA2Q96AD5 504 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 RMDN1Q96DB5 314 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 BPIFA2Q96DR5 249 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SGF29Q96ES7 293 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CAPNS2Q96L46 248 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 RMDN2Q96LZ7 410 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 TTYH2Q9BSA4 534 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CHMP4AQ9BY43 222 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 FAM129AQ9BZQ8 928 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 NT5DC2Q9H857 520 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 VIPAS39Q9H9C1 493 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 KCNK13Q9HB14 408 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 NMUR1Q9HB89 426 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 AMBNQ9NP70 447 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 MYOZ2Q9NPC6 264 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ANKEF1Q9NU02 776 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 TMEM9Q9P0T7 183 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ABCD2Q9UBJ2 740 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CLEC4EQ9ULY5 219 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SNX7Q9UNH6 387 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CA5BQ9Y2D0 317 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 FBXO7Q9Y3I1 522 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa0.5□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 YDJCA8MPS7 323 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ZNF487B1APH4 448 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 E5RGE8 158 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CCSO14618 274 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SLC30A4O14863 429 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 PPIP5K2O43314 1243 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 PLOD3O60568 738 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 OR6A2O95222 327 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 GJB5O95377 273 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 STARD3NLO95772 234 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 GBAP04062 536 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CCDC175P0C221 793 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ODC1P11926 461 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 EEF2P13639 858 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 MDKP21741 143 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 GLRA1P23415 457 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 PTAFRP25105 342 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ACKR3P25106 362 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 GDF1P27539 372 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 HSPA4P34932 840 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 OR1D2P34982 312 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 RAD52P43351 418 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CRKLP46109 303 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SLC25A1P53007 311 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 IST1P53990 364 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 RAD23AP54725 363 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 GNB2P62879 340 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 FKBP1BP68106 108 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 GABPAQ06546 454 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CETN1Q12798 172 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ABRQ12979 859 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 SLC17A1Q14916 467 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ABRAXAS2Q15018 415 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 MAPK11Q15759 364 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ECSCRQ19T08 205 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 GSG1Q2KHT4 349 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 ARMCX4Q5H9R4 360 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 LRRC73Q5JTD7 316 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-447P-201ENST00000410293 CFAP58Q5T655 872 aa0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms