RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399598.6

UBXN2B-201, Transcript of UBX domain protein 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN2B, Length 5,068 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2B-201ENST00000399598 PEAK1Q9H792 1746 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 A0A1W2PPK0 400 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 A0A1W2PQY0 241 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 GNSP15586 552 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 LHCGRP22888 699 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 EDNRBP24530 442 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 NPRL3Q12980 569 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 RAB12Q6IQ22 244 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 GATSQ8NAP1 163 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 TMEM41AQ96HV5 264 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 C9J4A7 227 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 FAM189BP81408 668 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 FADDQ13158 208 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 FLYWCH1Q4VC44 716 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 HRASLS2Q9NWW9 162 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 MYH10P35580 1976 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 NRIP1P48552 1158 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 HLCSP50747 726 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 KCTD9Q7L273 389 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 PHC2Q8IXK0 858 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 DTX3Q8N9I9 347 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 MFSD2AQ8NA29 543 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 HSPA12BQ96MM6 686 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 F2RL3Q96RI0 385 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 ACSL6Q9UKU0 697 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 SH2B3Q9UQQ2 575 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 CARD8Q9Y2G2 431 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF806P0C7X5 589 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 FXYD6P3P58550 94 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 SCAPQ12770 1279 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 RASGRP3Q8IV61 690 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 MAPK15Q8TD08 544 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 NR4A3Q92570 626 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 SARDHQ9UL12 918 aa14.6□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 PRSS56P0CW18 603 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 FDXRP22570 491 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF81P51508 661 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 ZNF423Q2M1K9 1284 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 DEFB134Q4QY38 66 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 ENPP6Q6UWR7 440 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 SCML4Q8N228 414 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 ANKFN1Q8N957 763 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 OR8S1Q8NH09 359 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 BBS10Q8TAM1 723 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 ACOT12Q8WYK0 555 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 SGCDQ92629 289 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 ACSL5Q9ULC5 683 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 C2orf78A6NCI8 922 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 HPRP00739 348 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 JUPP14923 745 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 AGXTP21549 392 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 PROZP22891 400 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 TBPL1P62380 186 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 POGLUT1Q8NBL1 392 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 OR8J1Q8NGP2 316 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 OR5J2Q8NH18 312 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.073e-7■■■■□ 21.2
UBXN2B-201ENST00000399598 OTUB2Q96DC9 234 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 RBP7Q96R05 134 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 LRRN3E7EW58 273 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 FAAHO00519 579 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 HTR6P50406 440 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 PHF19Q5T6S3 580 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 ISCA2Q86U28 154 aa14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
UBXN2B-201ENST00000399598 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms