RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398333.7

C15orf38-AP3S2-201, Transcript of C15orf38-AP3S2 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C15orf38-AP3S2, Length 2,439 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 SCARB2Q14108 478 aa16.08■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa16.08■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 UPRTQ96BW1 309 aa16.08■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 MARVELD1Q9BSK0 173 aa16.08■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 C11orf16Q9NQ32 467 aa16.08■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 MCUBQ9NWR8 336 aa16.08■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 TMCC3Q9ULS5 477 aa16.08■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 AUP1Q9Y679 476 aa16.08■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ENPP4Q9Y6X5 453 aa16.08■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 MYL12BO14950 172 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 MYL12AP19105 171 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 DGKEP52429 567 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ZNF91Q05481 1191 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CHIT1Q13231 466 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 GANABQ14697 944 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CHRNA6Q15825 494 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 FLYWCH1Q4VC44 716 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ANXA8L1Q5VT79 327 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 C22orf42Q6IC83 251 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 C9orf62Q8N4C0 152 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 IL17RCQ8NAC3 791 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 WDR20Q8TBZ3 569 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 NUP50Q9UKX7 468 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 Q9Y3F1 56 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 LINC00862A6NCI5 91 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 WASHC1A8K0Z3 465 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 SLC43A1O75387 559 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CPEP16870 476 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 BPIP17213 487 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CD52P31358 61 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 SDC2P34741 201 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 IRS1P35568 1242 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 HNMTP50135 292 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CASP9P55211 416 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ZNF33BQ06732 778 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 RBBP4Q09028 425 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 MGAT3Q09327 533 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 MAB21L1Q13394 359 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CRB2Q5IJ48 1285 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ZNF730Q6ZMV8 503 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 FBXL6Q8N531 539 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 VPS37AQ8NEZ2 397 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 NFKBIDQ8NI38 313 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 QRFPRQ96P65 431 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 NELL2Q99435 816 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 C19orf43Q9BQ61 176 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 KATNB1Q9BVA0 655 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ANKRA2Q9H9E1 313 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 DNAJC11Q9NVH1 559 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 KLHL42Q9P2K6 505 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CRLS1Q9UJA2 301 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 PADI3Q9ULW8 664 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa16.07■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 INHAP05111 366 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 RHCEP18577 417 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CCR7P32248 378 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ABATP80404 500 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ACSM2AQ08AH3 577 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ILKQ13418 452 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CDKN3Q16667 212 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 LEXMQ3ZCV2 418 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 GCNT6Q5T4J0 391 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ZBTB37Q5TC79 503 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ACSM2BQ68CK6 577 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 C12orf73Q69YU5 71 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 MZT2BQ6NZ67 158 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 NXPE1Q8N323 547 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 OR4A15Q8NGL6 344 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 MYO19Q96H55 970 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 CRISPLD1Q9H336 500 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 TMEM38AQ9H6F2 299 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 NLKQ9UBE8 527 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 KCND3Q9UK17 655 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 FAM227AF5H4B4 570 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 GSTM1P09488 218 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ARSBP15848 533 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 ITPKAP23677 461 aa16.06■□□□□ 0.16
C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 FEN1P39748 380 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms