RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396847.7

TRIM5-203, Transcript of tripartite motif containing 5, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM5, Length 3,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5-203ENST00000396847 C14orf144Q96I85 54 aa7.13□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 GAL3ST4Q96RP7 486 aa7.13□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 GORASP2Q9H8Y8 452 aa7.13□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 TXNRD2Q9NNW7 524 aa7.13□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 KLHL9Q9P2J3 617 aa7.13□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 NLKQ9UBE8 527 aa7.13□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.13□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 CRYL1Q9Y2S2 319 aa7.13□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.13□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 A8MVJ9 347 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 H3BRB1 525 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 CDC7O00311 574 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 SLC1A7O00341 560 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 MYL12BO14950 172 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 PLOD3O60568 738 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 VPS4BO75351 444 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 SIX6O95475 246 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 MPC2O95563 127 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 IFNA4P05014 189 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 FGF4P08620 206 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 MYL12AP19105 171 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 HTR1EP28566 365 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 SCN1BQ07699 218 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 ITKQ08881 620 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 RCAN2Q14206 197 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 OR4D1Q15615 310 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 AAK1Q2M2I8 961 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 ARMC6Q6NXE6 501 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 ZNF511Q8NB15 262 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 ZNF555Q8NEP9 628 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 AP2M1Q96CW1 435 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 TEX37Q96LM6 180 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 COQ10AQ96MF6 247 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 SERINC2Q96SA4 455 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 RNF39Q9H2S5 420 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 SMURF2Q9HAU4 748 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 ABCB8Q9NUT2 735 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 AIG1Q9NVV5 245 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 CXorf65A6NEN9 183 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 URADA6NGE7 173 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 STX16O14662 325 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 CELF2O95319 508 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 GJA1P17302 382 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 GADD45AP24522 165 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 TNFSF8P32971 234 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 MPIP34949 423 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 KIR2DL3P43628 341 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 UFM1P61960 85 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 MARCH8Q5T0T0 291 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 THEM4Q5T1C6 240 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 C9orf131Q5VYM1 1079 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 SPATA19Q7Z5L4 167 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 ASPGQ86U10 573 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 PPTC7Q8NI37 304 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 MISP3Q96FF7 219 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 ZFP42Q96MM3 310 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 AMDHD1Q96NU7 426 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 PKP4Q99569 1192 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 C16orf70Q9BSU1 422 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 IFT27Q9BW83 186 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 TMEM30AQ9NV96 361 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 NEU3Q9UQ49 428 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 DSCR3O14972 297 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 SLC22A3O75751 556 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 S1PR4O95977 384 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 HCKP08631 526 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 PCMT1P22061 227 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 FDXRP22570 491 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 GALNSP34059 522 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 DCDC1P59894 354 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 GABARAPL2P60520 117 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 CHRNB3Q05901 458 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 CHRNA6Q15825 494 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 TTC23Q5W5X9 447 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 RIMKLAQ8IXN7 391 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 NAGSQ8N159 534 aa7.12□□□□□ -1.27
TRIM5-203ENST00000396847 ZNF614Q8N883 585 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms