RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 NDUFA9Q16795 377 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 COQ5Q5HYK3 327 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 GPR135Q8IZ08 494 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 CA13Q8N1Q1 262 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 DPP10Q8N608 796 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 DEFB124Q8NES8 71 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 FAM186AA6NE01 2351 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 A0A1W2PS29 197 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 GSC2O15499 205 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 ALAS2P22557 587 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 CDKN2CP42773 168 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 ACY1Q03154 408 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 NFYCQ13952 458 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 SYT16Q17RD7 645 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 STARD8Q92502 1023 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 MTERF3Q96E29 417 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 WDR41Q9HAD4 459 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 SLAMF7Q9NQ25 335 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 HCN3Q9P1Z3 774 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 CES1P1Q9UKY3 287 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 MAU2Q9Y6X3 613 aa21.99■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 CCL4P13236 92 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 DRD2P14416 443 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 GSTM5P46439 218 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 C6orf10Q5SRN2 563 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 FAM47BQ8NA70 645 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 TMEM52Q8NDY8 209 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 LRRC58Q96CX6 371 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 CLPTM1LQ96KA5 538 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 PACSIN3Q9UKS6 424 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 MAPRE3Q9UPY8 281 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 SCN2AQ99250 2005 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 KIF26BQ2KJY2 2108 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 EFCAB7A8K855 629 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 CHST10O43529 356 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 NSA2O95478 260 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 C1QCP02747 245 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 GSNP06396 782 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 CPN2P22792 545 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 ZNF750Q32MQ0 723 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 GTDC1Q4AE62 458 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 TLDC1Q6P9B6 456 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 SLCO6A1Q86UG4 719 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 CTRCQ99895 268 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 FAIM2Q9BWQ8 316 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 FANCEQ9HB96 536 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 LYRM4Q9HD34 91 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 CYR61O00622 381 aa21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 PTPN6P29350 595 aa21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 EMP3P54852 163 aa21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 SHC2P98077 582 aa21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 TNFRSF17Q02223 184 aa21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 NHLH1Q02575 133 aa21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 ILKQ13418 452 aa21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 FAM214AQ32MH5 1076 aa21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 MSRB3Q8IXL7 192 aa21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 KIAA2013Q8IYS2 634 aa21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 BMPERQ8N8U9 685 aa21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 SLC38A9Q8NBW4 561 aa21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 UTS2RQ9UKP6 389 aa21.97■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 C1orf226A1L170 272 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 TBX19O60806 448 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 GUCY1B2O75343 617 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 NR2F6P10588 404 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 RPL3P39023 403 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 OR1D4P47884 311 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 PSME3P61289 254 aa21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CNN3-202ENST00000394202 SLC48A1Q6P1K1 146 aa21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms