RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 CAV3P56539 151 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 SPHARQ15513 63 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC14A2Q15849 920 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 B3GLCTQ6Y288 498 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 IRF7Q92985 503 aa8.31□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 LRRC72A6NJI9 287 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 ANHXE9PGG2 379 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 SEC14L2O76054 403 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 FGF18O76093 207 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 PTHP01270 115 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 PRNPP04156 253 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 CD9P21926 228 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 IGFBP4P22692 258 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 VIPR2P41587 438 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 CD97P48960 835 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 PROX2Q3B8N5 592 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 AFMIDQ63HM1 303 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 SDE2Q6IQ49 451 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC80Q76M96 950 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 MMP21Q8N119 569 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 MUL1Q969V5 352 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 TADA1Q96BN2 335 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM19Q96HH6 336 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 LRR1Q96L50 414 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 NTMT1Q9BV86 223 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 ACTL8Q9H568 366 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 NECTIN3Q9NQS3 549 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 GFRA2O00451 464 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 NDUFS4O43181 175 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 KCNK5O95279 499 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 C1QCP02747 245 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 PRKAR1AP10644 381 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 LHCGRP22888 699 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 PPM1AP35813 382 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 CRISP1P54107 249 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM46CQ5VWP2 391 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF544Q6NX49 715 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 ARMC6Q6NXE6 501 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 C11orf88Q6PI97 169 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 OR4N5Q8IXE1 308 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 OR8H1Q8NGG4 311 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 OR5AR1Q8NGP9 310 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 OR9A1PQ8NGU1 263 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 OR5M11Q96RB7 305 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 PIP5K1AQ99755 562 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 PRR14Q9BWN1 585 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 MED16Q9Y2X0 877 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 FAM170BA6NMN3 283 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 TGM5O43548 720 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 LAMP2P13473 410 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 PSMB5P28074 263 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 GABARAPL2P60520 117 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 TUBA1BP68363 451 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 PPP2R2BQ00005 443 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 SLC3A1Q07837 685 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 CAMK1Q14012 370 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 KCNJ8Q15842 424 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 LIPJQ5W064 366 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 CD300LGQ6UXG3 332 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 TUBA1AQ71U36 451 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 C6orf120Q7Z4R8 191 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 CADM3Q8N126 398 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 ASB11Q8WXH4 323 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 TMCO6Q96DC7 493 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 LMLNQ96KR4 655 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 RACGAP1Q9H0H5 632 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 SNX7Q9UNH6 387 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 RP1P56715 2156 aa8.3□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD42-202ENST00000393389 PITPNM1O00562 1244 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms