RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 ITGA1P56199 1179 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CLDN6P56747 220 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 TNFRSF17Q02223 184 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 MSRB3Q8IXL7 192 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 KIAA2013Q8IYS2 634 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CA13Q8N1Q1 262 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 PANX1Q96RD7 426 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 FANCEQ9HB96 536 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CUTCQ9NTM9 273 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 KCMF1Q9P0J7 381 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 VAPAQ9P0L0 249 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 NDOR1Q9UHB4 597 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 PHF11Q9UIL8 331 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 DAPP1Q9UN19 280 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CLCA2Q9UQC9 943 aa16.81■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 H3BMH7 237 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 RFXANKO14593 260 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 PDPK1O15530 556 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ANP32DO95626 131 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 C6orf47O95873 294 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 GP1BAP07359 652 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 DRD2P14416 443 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 PTGER1P34995 402 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SELPLGQ14242 412 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SYT16Q17RD7 645 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ZNF750Q32MQ0 723 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ANXA8L1Q5VT79 327 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 TTLL10Q6ZVT0 673 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SCUBE1Q8IWY4 988 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 GPR135Q8IZ08 494 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 OR4A15Q8NGL6 344 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 OR6C1Q96RD1 312 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CGREF1Q99674 301 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 UTS2RQ9UKP6 389 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 DMDP11532 3685 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 A0A096LPI6 279 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 A0A1W2PS29 197 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 FITM1A5D6W6 292 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 A8MUI8 341 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 FAM227AF5H4B4 570 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 NVLO15381 856 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 LRP3O75074 770 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 C1QCP02747 245 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 C8orf89P0DMQ9 161 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SLC6A2P23975 617 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 PDX1P52945 283 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 MTPNP58546 118 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CEACAM7Q14002 265 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 C16orf72Q14CZ0 275 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 HPS6Q86YV9 775 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CLEC4FQ8N1N0 589 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 FAM156AQ8NDB6 213 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SPAG4Q9NPE6 437 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SLAMF7Q9NQ25 335 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 OCIAD1Q9NX40 245 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ERVK-11Q9UQG0 969 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 MAU2Q9Y6X3 613 aa16.8■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 MYO15AQ9UKN7 3530 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 C1orf226A1L170 272 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 H0YHG0 523 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 NME4O00746 187 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CHST10O43529 356 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ALAS2P22557 587 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 STPG1Q5TH74 334 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ZNF621Q6ZSS3 439 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 ARHGAP24Q8N264 748 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 TMEM52Q8NDY8 209 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 VPS37AQ8NEZ2 397 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CCDC115Q96NT0 180 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 LYRM4Q9HD34 91 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 CMTM6Q9NX76 183 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 FRYLO94915 3013 aa16.79■□□□□ 0.28
LTV1-201ENST00000367576 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms