RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 RPL9P32969 192 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 CHKAP35790 457 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 HPCAL1P37235 193 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TALDO1P37837 337 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 HAAOP46952 286 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NDST1P52848 882 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PRKAA2P54646 552 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TMBIM6P55061 237 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 MLLT10P55197 1068 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 CDKL1Q00532 357 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 IFITM3Q01628 133 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 CAV1Q03135 178 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 IKQ13123 557 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 BAMBIQ13145 260 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PTK6Q13882 451 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TFDP1Q14186 410 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 GNA13Q14344 377 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NFE2L1Q14494 772 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SQLEQ14534 574 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PDK1Q15118 436 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 CCNG2Q16589 344 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 EXOC3L4Q17RC7 722 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 GTDC1Q4AE62 458 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 CAVIN4Q5BKX8 364 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 RABGAP1LQ5R372 815 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 FAM83BQ5T0W9 1011 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ATAD3BQ5T9A4 648 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 C6orf163Q5TEZ5 329 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 LPCAT4Q643R3 524 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 C11orf63Q6NUN7 778 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ZFP1Q6P2D0 407 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 FAM47EQ6ZV65 393 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NIPA1Q7RTP0 329 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 MIER3Q7Z3K6 550 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PRUNE1Q86TP1 453 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 LRRTM1Q86UE6 522 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SLC35F3Q8IY50 421 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TTC5Q8N0Z6 440 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 KIAA0895Q8NCT3 520 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ICA1LQ8NDH6 482 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 IL17REQ8NFR9 667 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 BEST2Q8NFU1 509 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TSPAN14Q8NG11 270 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TTLQ8NG68 377 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 OR5R1Q8NH85 324 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 GSDMBQ8TAX9 411 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 VPS33AQ96AX1 596 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SH3KBP1Q96B97 665 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 APOPT1Q96IL0 206 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 CDHR1Q96JP9 859 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 RNF170Q96K19 258 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 CEP170P1Q96L14 293 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 BCL7BQ9BQE9 202 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD60Q9BZ19 345 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 NMUR2Q9GZQ4 415 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SLA2Q9H6Q3 261 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 WASH6PQ9NQA3 447 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 FBXO8Q9NRD0 319 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PNPLA3Q9NST1 481 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PKD2L2Q9NZM6 624 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SLC24A2Q9UI40 661 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 ITGA11Q9UKX5 1188 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TMCC3Q9ULS5 477 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 AP3M1Q9Y2T2 418 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SNX24Q9Y343 169 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 SBF2Q86WG5 1849 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-202ENST00000367364 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 A0A087WXM4 84 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 A0A0G2JMP0 313 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PPW3 197 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ISPDA4D126 451 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 PI4KAP2A4QPH2 592 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 LRRIQ4A6NIV6 560 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 SDR42E2A6NKP2 422 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 DUXAA6NLW8 204 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 TCP10L2B9ZVM9 353 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 CLDN25C9JDP6 229 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 H7C0C1 242 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRC-202ENST00000367364 ZBTB43O43298 467 aa3.33□□□□□ -1.88
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