RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa3.96□□□□□ -1.77
CENPF-201ENST00000366955 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 KLHL33A6NCF5 533 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 FOXO6A8MYZ6 492 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 RCBTB2O95199 551 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 KLK1P06870 262 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 IL12AP29459 219 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 PCGF2P35227 344 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 BDKRB1P46663 353 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 MERTKQ12866 999 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 VEZF1Q14119 521 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 GAREM2Q75VX8 874 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 C16orf78Q8WTQ4 265 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 TCTN2Q96GX1 697 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 EFCAB11Q9BUY7 163 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 PLAGL1Q9UM63 463 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 AP1G1O43747 822 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 PCDH7O60245 1069 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 GABRA3P34903 492 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 AQP5P55064 265 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 IL20RBQ6UXL0 311 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 CLNKQ7Z7G1 428 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 JAGN1Q8N5M9 183 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 PNPLA1Q8N8W4 532 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 HSPBAP1Q96EW2 488 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 RHNO1Q9BSD3 238 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 BTNL10A8MVZ5 291 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 PRSS44E7EML9 344 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 PPEF2O14830 753 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 PLOD3O60568 738 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 EDNRAP25101 427 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 ICAM3P32942 547 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 MAGEA2P43356 314 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 GATMP50440 423 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 RACK1P63244 317 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 DEFB103AP81534 67 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 DSC2Q02487 901 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 CTBP1Q13363 440 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 DPYSL3Q14195 570 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 AADACL2Q6P093 401 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 PM20D2Q8IYS1 436 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 PSMG2Q969U7 264 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 OR5B2Q96R09 309 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 GINS3Q9BRX5 216 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 CCSER2Q9H7U1 834 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 PLCH1Q4KWH8 1693 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 HAS3O00219 553 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 MATN3O15232 486 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 VNN2O95498 520 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 CSTAP01040 98 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 L1CAMP32004 1257 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 TEX44Q53QW1 395 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 YIPF7Q8N8F6 280 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 GOLM1Q8NBJ4 401 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 PSD4Q8NDX1 1056 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 STEAP2Q8NFT2 490 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 CEP295NLQ96MC4 621 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 WNT16Q9UBV4 365 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 DUSP13Q9UII6 198 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 A0A1W2PP18 115 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 A0A1W2PRQ8 180 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 D6RAR5 112 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 TLR4O00206 839 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 CNIH1O95406 144 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 C9P02748 559 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 LCATP04180 440 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 IFNW1P05000 195 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 GSTM3P21266 225 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 AQP1P29972 269 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 HOXA9P31269 272 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 SFTPDP35247 375 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 OGDHQ02218 1023 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 EEF1DP3Q658K8 133 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 NPNTQ6UXI9 565 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 HIPK1Q86Z02 1210 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 CCDC36Q8IYA8 594 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 SLC43A2Q8N370 569 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 PRR18Q8N4B5 295 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 ZNF540Q8NDQ6 660 aa3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CENPF-201ENST00000366955 OR5P2Q8WZ92 322 aa3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms