RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 MC1RQ01726 317 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 ROM1Q03395 351 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 UGT8Q16880 541 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 DEFB109BQ30KR1 87 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM214AQ32MH5 1076 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 FBXO48Q5FWF7 155 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 COX15Q7KZN9 410 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 VN1R4Q7Z5H5 301 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 SYVN1Q86TM6 617 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPSM1Q86YR5 675 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 CSNK1A1LQ8N752 337 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 EXD3Q8N9H8 876 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDPRQ8NCN5 879 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 ABHD11Q8NFV4 315 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 KCTD4Q8WVF5 259 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC5A11Q8WWX8 675 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 NEIL2Q969S2 332 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 NXNL1Q96CM4 212 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 TM4SF19Q96DZ7 209 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 WBP1Q96G27 269 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 TSNARE1Q96NA8 513 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 CATSPER2Q96P56 530 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPR78Q96P69 363 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATOH8Q96SQ7 321 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 EGFL8Q99944 293 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 SARGQ9BW04 601 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 ALG9Q9H6U8 611 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF180Q9UJW8 692 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC22A14Q9Y267 594 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 ACOT9Q9Y305 439 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHD6Q8TD26 2715 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANKRD12Q6UB98 2062 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 C9J4A7 227 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 UBXN8O00124 270 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 FOXS1O43638 330 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 KERAO60938 352 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 WDR47O94967 919 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 KLHL2O95198 593 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 MTHFD2P13995 350 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 TYK2P29597 1187 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 MSH2P43246 934 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 HSPA7P48741 367 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 SERPINB9P50453 376 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCR8P51685 355 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 REEP5Q00765 189 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 NFYCQ13952 458 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 LY6DQ14210 128 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC29A2Q14542 456 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 CDKL4Q5MAI5 379 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 MLIPQ5VWP3 458 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 SULT1C3Q6IMI6 304 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC91Q7Z6B0 441 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF740Q8NDX6 193 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 STAG3L4Q8TBR4 150 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 EXT2Q93063 718 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 ESAMQ96AP7 390 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 FKBP10Q96AY3 582 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 CABS1Q96KC9 395 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 MACROD1Q9BQ69 325 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 C17orf62Q9BQA9 187 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 SEMA4CQ9C0C4 833 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 NMRAL1Q9HBL8 299 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 TLK1Q9UKI8 766 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAU2Q9Y6X3 613 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRBC2A0A5B9 178 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 VSTM2BA6NLU5 285 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 I3L1I5 382 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 TXNDC9O14530 226 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPR42O15529 346 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR1F1O43749 312 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRAMEF4O60810 478 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 C1QL1O75973 258 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLU7O95391 586 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms