RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CD3GP09693 182 aa10.64□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CHATP28329 748 aa10.64□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 RELAQ04206 551 aa10.64□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa10.64□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 GATA6Q92908 595 aa10.64□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 C19orf12Q9NSK7 152 aa10.64□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 DTLQ9NZJ0 730 aa10.64□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CYP8B1Q9UNU6 501 aa10.64□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ASB3Q9Y575 518 aa10.64□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A0G2JMP0 313 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC7A4O43246 635 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ADAP00813 363 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 GP1BBP13224 206 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 KLBQ86Z14 1044 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 OR4M2Q8NGB6 313 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PNPLA2Q96AD5 504 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC41A3Q96GZ6 507 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 LRCH3Q96II8 777 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 RNF208Q9H0X6 261 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PRDM9Q9NQV7 894 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 GALPQ9UBC7 116 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ACSL5Q9ULC5 683 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 OR6C65A6NJZ3 312 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 WNT10BO00744 389 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SOCS2O14508 198 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 DDNO94850 711 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 TGM6O95932 706 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 EPHA1P21709 976 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 LMO2P25791 158 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 GDF5P43026 501 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 OR52E8Q6IFG1 317 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PXKQ7Z7A4 578 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CMTM7Q96FZ5 175 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 DKKL1Q9UK85 242 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CXCL11O14625 94 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 FRKP42685 505 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CAP1Q01518 475 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SP2Q02086 613 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PTERQ96BW5 349 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 OR2M4Q96R27 311 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ICKQ9UPZ9 632 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ANKRD33BA6NCL7 494 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SGCEO43556 437 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 B4GALT4O60513 344 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 COQ9O75208 318 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC34A2O95436 690 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 UNGP13051 313 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 HTD2P86397 168 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 GAS6Q14393 721 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.714e-6■■□□□ 12.9
GTF3C1-201ENST00000356183 FRG2Q64ET8 278 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 GID4Q8IVV7 300 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM86B1Q8N7N1 296 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 TTLQ8NG68 377 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 OR4K17Q8NGC6 315 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 OR56B2PQ8NGI1 322 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 TFAP2BQ92481 460 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 FRG2BQ96QU4 278 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 MAGEH1Q9H213 219 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 MYNNQ9NPC7 610 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 LDB2O43679 373 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 HOXC6P09630 235 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 L1CAMP32004 1257 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 TLE3Q04726 772 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 GINS1Q14691 196 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 CLCA4Q14CN2 919 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 TRAM1Q15629 374 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM214AQ32MH5 1076 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 MGAT4BQ9UQ53 548 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa10.63□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 NFAT5O94916 1531 aa10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 C2CD4BA6NLJ0 364 aa10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 K7EPK0 472 aa10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 GABRDO14764 452 aa10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 H2BFMP0C1H6 154 aa10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 AGTR1P30556 359 aa10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PTH2RP49190 550 aa10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ARSFP54793 590 aa10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 ID2Q02363 134 aa10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PRKCZQ05513 592 aa10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 RNF151Q2KHN1 245 aa10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 PDZD7Q9H5P4 517 aa10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 METTL7AQ9H8H3 244 aa10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 COPZ2Q9P299 210 aa10.62□□□□□ -0.71
GTF3C1-201ENST00000356183 GLOD5A6NK44 160 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms