RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000346501.8

TSPAN4-201, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TSPAN4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-201ENST00000346501 B3GNT7Q8NFL0 401 aa14.77□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.77□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 CDK15Q96Q40 435 aa14.77□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.77□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 MID2Q9UJV3 735 aa14.77□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 PPT2Q9UMR5 302 aa14.77□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 SCN2AQ99250 2005 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 TLDC2A0PJX2 215 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 ESPNB1AK53 854 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 CYR61O00622 381 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 PLPP1O14494 284 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 COPEO14579 308 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 GUCY1B2O75343 617 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 SEMA3DO95025 777 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 KRT6AP02538 564 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 KRT6BP04259 564 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 MYL2P10916 166 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 IMPDH1P20839 514 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 KRT6CP48668 564 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 CLCQ05315 142 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 CCDC153Q494R4 210 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 EMBQ6PCB8 327 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 CLNKQ7Z7G1 428 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 SHISA5Q8N114 240 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 BCORP1Q8N888 145 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 WDR20Q8TBZ3 569 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 ELP5Q8TE02 316 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 TANKQ92844 425 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 VMP1Q96GC9 406 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 C5orf34Q96MH7 638 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 EPB41L4BQ9H329 900 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 CSAG2Q9Y5P2 127 aa14.76□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 NBASA2RRP1 2371 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 GABRR3A8MPY1 467 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 PRAMEF2O60811 474 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 RASAL1O95294 804 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 CRYABP02511 175 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 SHBGP04278 402 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 CD46P15529 392 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 HMOX2P30519 316 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 NEK2P51955 445 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 CDH13P55290 713 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 TRAF3Q13114 568 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 SGO1Q5FBB7 561 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 CFAP157Q5JU67 520 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 ZNF678Q5SXM1 525 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 FCRLBQ6BAA4 426 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 BEST3Q8N1M1 668 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 TMEM178AQ8NBL3 297 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 ART5Q96L15 291 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 DGAT2Q96PD7 388 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 CSF3RQ99062 836 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 KCMF1Q9P0J7 381 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 COPS7AQ9UBW8 275 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.75□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 H3BQF6 201 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 DLX3O60479 287 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 ZFAND5O76080 213 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 F10P00742 488 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 TUBBP07437 444 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 GNLYP22749 145 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 HSD17B3P37058 310 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 PRKAA2P54646 552 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 VSNL1P62760 191 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 TNFRSF17Q02223 184 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 FHL5Q5TD97 284 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 WDR93Q6P2C0 686 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 RNF175Q8N4F7 328 aa14.74□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 CCNYL1Q8N7R7 359 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms