RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 ZNF404Q494X3 552 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 GALNT7Q86SF2 657 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 SLC22A15Q8IZD6 547 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 GAL3ST1Q99999 423 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 C20orf27Q9GZN8 174 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 AREL1O15033 823 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 CDRT1O95170 752 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 HLA-DPB1P04440 258 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 BMP2P12643 396 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 MAGEA3P43357 314 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 TPTEP56180 551 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 PAMR1Q6UXH9 720 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 VTCN1Q7Z7D3 282 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 ATOH8Q96SQ7 321 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 IFT52Q9Y366 437 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 FAM172BPA6NC97 362 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 FAAHO00519 579 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 FHP07954 510 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 NTSR1P30989 418 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 PON3Q15166 354 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 BTN2A1Q7KYR7 527 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 LINGO2Q7L985 606 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 HMGN2P46Q86SG4 172 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 C16orf78Q8WTQ4 265 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 EPYCQ99645 322 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 LGR4Q9BXB1 951 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 J3QLW9 94 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 ZNF19P17023 458 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 RCAN2Q14206 197 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 CATSPEREQ5SY80 951 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 C3orf30Q96M34 536 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 EHD1Q9H4M9 534 aa19.87■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 EDNRAP25101 427 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 FAM214AQ32MH5 1076 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 KLHDC9Q8NEP7 349 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 TMEM125Q96AQ2 219 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 INPP5KQ9BT40 448 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 IL21RQ9HBE5 538 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 ERVK-18Q9QC07 812 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 GRXCR1A8MXD5 290 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 HHLA1C9JL84 531 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 MAP2K4P45985 399 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 FAM189BP81408 668 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 SLC3A1Q07837 685 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 PLA2G15Q8NCC3 412 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 RDH14Q9HBH5 336 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 TMEM181Q9P2C4 612 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 FKBP7Q9Y680 259 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 PRSS21Q9Y6M0 314 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 MYO9BQ13459 2157 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 DRD2P14416 443 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 C1orf61Q13536 156 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 OR4C11Q6IEV9 310 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 RIT1Q92963 219 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 SLC17A9Q9BYT1 436 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 TMEM5Q9Y2B1 443 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 TNFRSF10BO14763 440 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 CD72P21854 359 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 ACSL1P33121 698 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 RAB28P51157 221 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 NPRL3Q12980 569 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 TMEM35AQ53FP2 167 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 TMEM107Q6UX40 140 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 MINDY2Q8NBR6 621 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 OR8D2Q9GZM6 311 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa19.86■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 GABRB3P28472 473 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 SLC7A9P82251 487 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 FCHO2Q0JRZ9 810 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 DTWD1Q8N5C7 304 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 OR7G3Q8NG95 312 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 OR8K5Q8NH50 307 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 TRIM2Q9C040 744 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 LIPT1Q9Y234 373 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 LATO43561 262 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 ITGA10O75578 1167 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 PITPNAQ00169 270 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 FLYWCH1Q4VC44 716 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 FAM26DQ5JW98 314 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 MLIPQ5VWP3 458 aa19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
NISCH-201ENST00000345716 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms