RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 GSRP00390 522 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 PLP2Q04941 152 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO43Q4G163 708 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 SDC3O75056 442 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 GRB7Q14451 532 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 FAM69BQ5VUD6 431 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 OR4C15Q8NGM1 316 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 G6PC3Q9BUM1 346 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 TREM1Q9NP99 234 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 POGLUT1Q8NBL1 392 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 F2RL3Q96RI0 385 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 RNF6Q9Y252 685 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 OR4D2P58180 307 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF550Q7Z398 422 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A16Q86VW1 577 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 APCDD1Q8J025 514 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 DTX3Q8N9I9 347 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 SLC37A3Q8NCC5 494 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 DEFB126Q9BYW3 111 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 NUDT15Q9NV35 164 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 OR1A2Q9Y585 309 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 MYADML2A6NDP7 307 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 KCNC1P48547 511 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 GINS1Q14691 196 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 UGT8Q16880 541 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 BBS10Q8TAM1 723 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 POPDC3Q9HBV1 291 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 DISC1C4P0D8 188 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 IQCF3P0C7M6 154 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC44A3Q8N4M1 653 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 TPSD1Q9BZJ3 242 aa21.5■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 SH2B3Q9UQQ2 575 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 H2BFMP0C1H6 154 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 GAS6Q14393 721 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 PDE7BQ9NP56 450 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 UNC119BA6NIH7 251 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 TP53I11O14683 189 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 LATO43561 262 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 FECHP22830 423 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 VIPR2P41587 438 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 CRTC1Q6UUV9 634 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 OR4N5Q8IXE1 308 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 DNAJB1P25685 340 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRM-201ENST00000332175 CDKN2DP55273 166 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 SELENOVP59797 346 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 NANOGP8Q6NSW7 305 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 NANOGQ9H9S0 305 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 ECH1Q13011 328 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 GRK1Q15835 563 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa21.48■■□□□ 1.03
PTPRM-201ENST00000332175 OR5P2Q8WZ92 322 aa21.48■■□□□ 1.03
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