RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GAB3Q8WWW8 586 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GAL3ST3Q96A11 431 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TM4SF19Q96DZ7 209 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM8Q9BZR9 551 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCG4Q9H172 646 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SEMA6CQ9H3T2 930 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL31Q9H511 634 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GORASP2Q9H8Y8 452 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TAS2R9Q9NYW1 312 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 EHD3Q9NZN3 535 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PILRAQ9UKJ1 303 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GMEB1Q9Y692 573 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0A6YYD5 115 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf226A1L170 272 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 H3BNX3 289 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 NOBOXO60393 691 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PROS1P07225 676 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CDH3P22223 829 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CDKN2CP42773 168 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 RXRGP48443 463 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MAZP56270 477 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4D2P58180 307 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 BTN3A2P78410 334 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 HYAL2Q12891 473 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MUM1Q2TAK8 710 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB133Q30KQ1 61 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 C14orf28Q4W4Y0 310 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 VN1R4Q7Z5H5 301 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CALHM3Q86XJ0 350 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MICU2Q8IYU8 434 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CLECL1Q8IZS7 167 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CATSPER1Q8NEC5 780 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CANT1Q8WVQ1 401 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5P2Q8WZ92 322 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 RSC1A1Q92681 617 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MACROD1Q9BQ69 325 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC3Q9BQI4 270 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA9Q9BWV2 254 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 UGT2B28Q9BY64 529 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 YY1AP1Q9H869 796 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 LHX9Q9NQ69 397 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC6A13Q9NSD5 602 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GIMAP4Q9NUV9 329 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ARMC1Q9NVT9 282 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MS4A12Q9NXJ0 267 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 POMT2Q9UKY4 750 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 AURKCQ9UQB9 309 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC42Q9Y546 428 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0G2JN53 185 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM220BPB1ANY3 271 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CXCR6O00574 342 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PDPK1O15530 556 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 B3GALT2O43825 422 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PEX1O43933 1283 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TMPRSS11DO60235 418 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CTSVO60911 334 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SDC3O75056 442 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 C6orf47O95873 294 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 NTRK1P04629 796 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FCGR1AP12314 374 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 NCK1P16333 377 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GGT1P19440 569 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 UQCRC2P22695 453 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CNR2P34972 360 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CTSKP43235 329 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 EPHA4P54764 986 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB8AP61006 207 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 HBA1P69905 142 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIP10Q15642 601 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GTDC1Q4AE62 458 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TBCELQ5QJ74 424 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PMS2CLQ68D20 193 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms